UMI summary

根据featureCounts的基因定量结果,结合Cellbarcode和UMI进行单细胞基因表达量统计,细胞数目和UMI的评估结果如下:

{% for item in count_summary %} {% if loop.first %} {% for i in item %} {% endfor %} {% else %} {% for i in item %} {% endfor %} {% endif %} {% endfor %}
{{ i|e }}
{{ i|e }}

(1) SampleName:样品名

(2) Cells_number:细胞数目

(3) Saturation:所有细胞中,有多于2条Reads支持的UMI的数目占UMI总数目的比例

(4) Mean_Reads:每个细胞测到的平均Reads数目

(5) Median_UMIs:每个细胞的UMI数目的中位数

(6) Total_Genes:所有细胞检测到的基因数目 (去重复)

(7) Median_Genes:每个细胞检测基因数目的中位数


UMI数目分布图形展示如下: