LICENSE
README.md
pyproject.toml
src/phaselab/__init__.py
src/phaselab.egg-info/PKG-INFO
src/phaselab.egg-info/SOURCES.txt
src/phaselab.egg-info/dependency_links.txt
src/phaselab.egg-info/entry_points.txt
src/phaselab.egg-info/requires.txt
src/phaselab.egg-info/top_level.txt
src/phaselab/chromatin/__init__.py
src/phaselab/chromatin/accessibility.py
src/phaselab/chromatin/atac_integration.py
src/phaselab/chromatin/integration.py
src/phaselab/chromatin/methylation.py
src/phaselab/chromatin/nucleosome.py
src/phaselab/chromatin/tissue_models.py
src/phaselab/circadian/__init__.py
src/phaselab/circadian/kuramoto.py
src/phaselab/circadian/multi_tissue.py
src/phaselab/circadian/sms_model.py
src/phaselab/core/__init__.py
src/phaselab/core/coherence.py
src/phaselab/core/constants.py
src/phaselab/core/hamiltonians.py
src/phaselab/crispr/__init__.py
src/phaselab/crispr/base_editing.py
src/phaselab/crispr/editors.py
src/phaselab/crispr/enhancer.py
src/phaselab/crispr/interference.py
src/phaselab/crispr/knockout.py
src/phaselab/crispr/multiguide.py
src/phaselab/crispr/pam_scan.py
src/phaselab/crispr/pipeline.py
src/phaselab/crispr/prime_editing.py
src/phaselab/crispr/scoring.py
src/phaselab/delivery/__init__.py
src/phaselab/delivery/aav.py
src/phaselab/delivery/immunogenicity.py
src/phaselab/drug/__init__.py
src/phaselab/drug/chronotherapy.py
src/phaselab/drug/pharmacokinetics.py
src/phaselab/drug/variability.py
src/phaselab/io/__init__.py
src/phaselab/io/export.py
src/phaselab/io/report.py
src/phaselab/protein/__init__.py
src/phaselab/protein/binding.py
src/phaselab/protein/dynamics.py
src/phaselab/protein/folding.py
src/phaselab/targets/PTEN.yaml
src/phaselab/targets/RAI1.yaml
src/phaselab/targets/SCN2A.yaml
src/phaselab/targets/__init__.py
src/phaselab/targets/config.py
src/phaselab/therapy/__init__.py
src/phaselab/therapy/dosage.py
src/phaselab/therapy/efficacy.py
tests/test_circadian.py
tests/test_core.py
tests/test_crispr.py
tests/test_expanded_crispr.py
tests/test_v050_modules.py