LICENSE
MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
src/FinaleToolkit.egg-info/PKG-INFO
src/FinaleToolkit.egg-info/SOURCES.txt
src/FinaleToolkit.egg-info/dependency_links.txt
src/FinaleToolkit.egg-info/entry_points.txt
src/FinaleToolkit.egg-info/requires.txt
src/FinaleToolkit.egg-info/top_level.txt
src/finaletoolkit/__init__.py
src/finaletoolkit/version.py
src/finaletoolkit/__pycache__/__init__.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/version.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/cli/__init__.py
src/finaletoolkit/cli/main_cli.py
src/finaletoolkit/frag/__init__.py
src/finaletoolkit/frag/adjust_wps.py
src/finaletoolkit/frag/cleavage_profile.py
src/finaletoolkit/frag/coverage.py
src/finaletoolkit/frag/delfi.py
src/finaletoolkit/frag/delfi_gc_correct.py
src/finaletoolkit/frag/delfi_merge_bins.py
src/finaletoolkit/frag/end_motifs.py
src/finaletoolkit/frag/frag_length.py
src/finaletoolkit/frag/multi_wps.py
src/finaletoolkit/frag/wps.py
src/finaletoolkit/frag/data/end_motif_f_profiles.tsv
src/finaletoolkit/genome/__init__.py
src/finaletoolkit/genome/gaps.py
src/finaletoolkit/genome/data/hg19.gap.txt.gz
src/finaletoolkit/genome/data/hg38.gap.txt.gz
src/finaletoolkit/utils/__init__.py
src/finaletoolkit/utils/agg_bw.py
src/finaletoolkit/utils/cli_hist.py
src/finaletoolkit/utils/filter_bam.py
src/finaletoolkit/utils/utils.py
tests/test_agg_bw.py
tests/test_cleavage_profile.py
tests/test_cli_entry.py
tests/test_coverage.py
tests/test_delfi.py
tests/test_end_motifs.py
tests/test_frag_io.py
tests/test_frag_length.py
tests/test_gaps.py
tests/test_utils.py
tests/test_wps.py