API

• py_crispr_analyser package
  • Submodules
  • py_crispr_analyser.align module
    • find_off_targets()
    • find_off_targets_cpu()
    • find_off_targets_kernel()
    • print_off_targets()
    • reverse_complement_binary()
    • run()
  • py_crispr_analyser.gather module
    • gather()
    • match_pam()
    • run()
  • py_crispr_analyser.index module
    • create_metadata()
    • index()
    • parse_record()
    • run()
  • py_crispr_analyser.search module
    • run()
    • search()
  • py_crispr_analyser.utils module
    • Metadata
      • Metadata.assembly
      • Metadata.number_of_sequences
      • Metadata.offset
      • Metadata.sequence_length
      • Metadata.species_id
      • Metadata.species_name
    • check_file_header()
    • get_file_metadata()
    • get_guides()
    • parse_c_string()
    • print_metadata()
    • reverse_complement()
    • sequence_to_binary_encoding()
  • Module contents