Metadata-Version: 2.4
Name: ilaydaMSA
Version: 0.1.0
Summary: Educational Clustal Omega implementation for Bioinformatics Multiple Sequence Alignment
Author: İlayda
Classifier: Programming Language :: Python :: 3
Classifier: Operating System :: OS Independent
Requires-Python: >=3.6
Description-Content-Type: text/markdown
Dynamic: author
Dynamic: classifier
Dynamic: description
Dynamic: description-content-type
Dynamic: requires-python
Dynamic: summary

# ilaydaMSA

Bu proje, Biyoinformatik dersi için Çoklu Dizi Hizalaması (Multiple Sequence Alignment - MSA) amacıyla sıfırdan geliştirilmiş, eğitim amaçlı bir Clustal Omega algoritması kütüphanesidir.

İçerdiği algoritmalar ve adımlar:

- K-mer tabanlı uzaklık matrisi hesaplama
- UPGMA yöntemi ile Kılavuz Ağaç (Guide Tree) oluşturma
- Profile-HMM tabanlı Kademeli Hizalama (Progressive Alignment)
- Consensus Sequence oluşturma
- Hizalama istatistiklerini raporlama

## Kurulum

Bu kütüphaneyi bilgisayarınıza indirmek için aşağıdaki komutu terminalinizde çalıştırabilirsiniz:

```bash
pip install ilaydaMSA
```
