ABIDE / ADNI / REST-meta-MDD / ADHD-200:下载什么

官方入口核查日期:2026-09-12。数据集名称不决定文件格式、图谱或诊断编码;下面按实际发布层级分别处理。

数据源 能拿到哪类数据 获取入口及条件 交给本库的文件
ABIDE I / II 静息 BOLD、结构像和表型;另有 PCP 预处理影像/ROI 时序 官方数据库入口,NITRC/IDA 等路径可能需账号;ABIDE IABIDE II 有站点采集信息 原始 BOLD/T1 先做预处理;PCP 时序可从表格入口提取;PCP 影像需确认 pipeline、滤波、GSR 与空间
ADHD-200 BIDS 格式原始 BOLD + T1 + 站点级 JSON;另有预处理发布 官方 AWS 下载说明 指向匿名 s3://fcp-indi/data/Projects/ADHD200/RawDataBIDS项目页 有原有 NITRC 入口和使用说明 原始 *_bold.nii.gz + *_T1w.nii.gz 及继承 JSON,整理/验证 BIDS 后跑 fMRIPrep
ADNI 纵向影像;fMRI 为静息扫描,原始发布可能是 DICOM 数据申请入口 需审批后从 LONI IDA 下载;FAQ 建议从 DICOM 头核查采集时序;MRI Core 原始 DICOM 说明 为历史官方答复,具体下载选项以当前账户内为准 完整 DICOM 序列 → dcm2niix → BIDS → fMRIPrep;保留 subject/visit/series 对应,不能把纵向访问当成独立患者
REST-meta-MDD 官方共享主要为 R-fMRI 指标和中间结果;不等同于原始4D影像开放发布 官方共享说明数据仓库 DOI。需签署 DUA,按官方说明索取解压密码与表型 若获授权包里含 ROI 时序(如 MAT),显式指定时序变量与图谱顺序;若只有指标图或已算好的连接矩阵,不能当作原始时序重新提取

首次建议准备

  1. 先选一个 ADHD-200 或 ABIDE 受试者的一个静息 run,获取 BOLD、T1 和适用的采集 JSON。
  2. 若要尽快验证“影像到连接”,提供同一 run 的已预处理 BOLD、空间说明、混杂表和掩膜。不能把 raw BOLD 标为 preprocessed 以跳过预处理。
  3. REST-meta-MDD 先确认实际压缩包内文件、MAT 变量以及 ROI 排序,再决定时序入口或已有矩阵分析入口。
  4. ADNI 先确认账号权限及 fMRI 序列,不需要为了验证本库下载完整纵向数据库。

本次匿名目录实测

ADHD-200 官方 S3 目录可匿名列举。实测包含:

当前库的目录发现器针对 fMRIPrep derivatives,不是完整的 BIDS 元数据继承实现。原始 BIDS 的继承规则由 fMRIPrep/BIDS validator 处理。接收预处理单文件时,应提供最终有效的 TR/JSON。

数据保存与验证范围

所有真实样本保存在本库的忽略目录 .work/,不进入 wheel、源码包或 Git 发布。实际下载和读取结果以 验证记录 为准。未代签协议或访问 ADNI/MDD 受限数据。