grating_interf op• Datenarten: images × images → table
• Aufruf: import fullseye as fs; fs.ledger.grating_three_image_retrieve(sample_stack, reference_stack=None, steps_per_period_sample=None, steps_per_period_reference=None, min_visibility=0.02, distance_mm=None, analyzer_period_um=None, reference_exposure=1.0) (die Implementierung direkt: import gratinginterf; gratinginterf.grating_three_image_retrieve(sample_stack, reference_stack=None, steps_per_period_sample=None, steps_per_period_reference=None, min_visibility=0.02, distance_mm=None, analyzer_period_um=None, reference_exposure=1.0); aus dem Register: opsoptics.get("grating_three_image_retrieve"))
Trennt Transmission, differentielle Phase und Dunkelfeld aus zwei Phase-Stepping-Stapeln (mit und ohne Probe).
> Die ausführliche Beschreibung unten ist der Originaltext — Zusammenfassung und Überschriften sind übersetzt.
各画素で I_k = a·(1 + V·cos(φ − 2πk/P)) をあて(P = 1 周期のステップ数。None は N 等分)、透過 T = a_s/a_r、微分位相 φ = wrap(φ_s − φ_r)、暗視野 D = V_s/V_r を返す(Pfeiffer ら 2008, Nature Materials 7, 134 の定義)。P = N のときは fringe.wrapped_phase と fringe.modulation (N 段の位相シフトの標準式)をそのまま使い、P ≠ N(1 周期の両端を含む走査など)は 3 項の最小二乗。2 組のステップ数は違ってよい(各組を別々にあてる)。
reference_stack が None なら、試料の画像列だけから a・V・φ を返す(比は取らない)。distance_mm と analyzer_period_um を渡すと、屈折角 α = φ·p2/(2π d) [µrad] も返す。reference_exposure: 基準を試料の何倍の露光(1 枚あたりの光子数)で撮ったか。透過は a_s/(a_r/reference_exposure)。暗視野と微分位相は比と差なので露光に依らない(透過だけが露光の比で化ける)。
min_visibility: 基準の可視度がこれ未満の画素(格子の欠陥・影)は位相が決まらないので NaN にし、数を返す。全画素が NaN になるときは値を返さずに拒否する。
返り値 dict: transmission / dpc_rad / darkfield(いずれも (H, W)、無効画素は NaN)/ visibility_sample / visibility_reference / refraction_urad(幾何があるとき)/ fit_residual_sample / fit_residual_reference(正弦をあてた残差の RMS / 平均の中央値。1 周期のステップ数を間違えると大きくなる)/ n_invalid。Raises ValueError: 画像列が 3-D でない・3 枚未満・NaN/Inf、2 組の画素の形が違う、P ≤ 0、P が小さすぎて正弦が分けられない、有効な画素が 1 つも無い、幾何の片方だけ、正でない reference_exposure。
Jeder optics-Operator prüft seine Eingabe vor der Berechnung (nichts rutscht stillschweigend durch):
• Einheiten stecken im Argumentnamen — _mm / _um / _deg / _mrad. Eine Verwechslung von mm und µm stürzt nicht ab, sondern liefert eine plausibel aussehende falsche Antwort; der Name verhindert das. Aus der Größenordnung wird nie auf die Einheit geschlossen.
• Strings lösen ValueError aus — float('50') gelingt, sodass ein ungeparster Konfigurationswert als Länge durchrutschen würde (gemessen: thin_lens('50', '200') lieferte plausible 66,667 mm). bool wird als implizite Hochstufung True == 1 ebenfalls abgelehnt.
• complex / Masked Arrays lösen ValueError aus (nur reelle Slots; das stille Verwerfen des Imaginärteils bzw. Abstreifen der Maske wird abgelehnt). NaN/Inf löst bei jeder Eingabe ValueError aus.
• Division durch null und Verwandtes wird namentlich abgelehnt: Brennweite 0, Krümmungsradius 0, Brechzahl <= 0, undurchlässige Blende (alles 0, die Normierung wird 0/0), PSF mit Summe <= 0, Stokes-Vektor mit S0 = 0 und ein Objekt im vorderen Brennpunkt (Bild im Unendlichen).
• Nur zwei Operatoren liefern einen nicht-endlichen Wert, und beide halten das vertraglich fest: depth_of_field liefert jenseits der hyperfokalen Distanz far_mm = inf (genau das bedeutet die hyperfokale Distanz), und gaussian_beam liefert an der Taille wavefront_radius_mm = inf (der Krümmungsradius einer ebenen Wellenfront). Beide liefern zusätzlich einen endlichen Partner (far_is_infinite / curvature_per_mm). Jedes andere stille NaN/Inf wird intern erkannt und löst ValueError aus — "float64 ist übergelaufen" und "die Antwort ist unendlich" sind verschiedene Aussagen; die erste wird nie im Gewand der zweiten geliefert.
• Größenobergrenzen: erzeugte Gitter durch optics.MAX_GRID (4096), übergebene Felder/PSFs/Blenden durch optics.MAX_FIELD_ELEMENTS (2^24), ABCD-Elementketten durch optics.MAX_SYSTEM_ELEMENTS (1024), Zernike durch MAX_ZERNIKE_TERMS (512) / MAX_ZERNIKE_ORDER (40) / MAX_ZERNIKE_BASIS (2^25). Damit werden Pfade fail-closed geschlossen, in denen ein kleines Argument eine riesige interne Allokation auslöst (gemessen: n_max=40 × 4096² braucht 108 GB).
• Physikalisch unmögliche Zustände werden ebenfalls abgelehnt: Stokes-Vektor mit Polarisationsgrad > 1, negative Transmission, negative Intensität und ungültige Zernike-Indizes wie ungerades n-|m|.
• Leitfaden zur Familie optics_imaging
• Katalog der Beispieldaten (Download-URLs / Lizenzen) — 2-D nutzt skimage.data (BSD/Public Domain) plus synthetische Bilder, 3-D nennt Download-URLs echter Datenquellen (Stanford, PDS, …).
• Herkunft und Literatur der Operatoren — die Quellen der Forschung/Verfahren, auf denen diese Operatorfamilie beruht.
• Der kanonische Algorithmus (Autor, Jahr) und seine Anwendungen stehen im Familienleitfaden oben.
• grating_interferometry — py -3.11 examples/grating_interferometry.py
• poc_grating_interferometry — py -3.11 examples/poc_grating_interferometry.py
table als Eingabe)abcd_matrix · wavefront_stats · sfr_from_edge · paraxial_trace · seidel_coefficients · spot_stats · tolerance_analysis · wavefront_from_opd
grating_interf)talbot_grating_design · grating_stepping_simulate · darkfield_scatter_relation · talbot_carpet · talbot_source_visibility · grating_step_period_estimate · dpc_integrate
*Provenance: gratinginterf.py — OPTICS Operator-Registry. Diese Notiz wird von tools/opdocs.py md erzeugt (nicht von Hand bearbeiten).*
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