LICENSE
MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
setup.py
./kompot/__init__.py
./kompot/batch_utils.py
./kompot/fdr.py
./kompot/memory_utils.py
./kompot/resource_estimation.py
./kompot/settings.py
./kompot/utils.py
./kompot/validation.py
./kompot/version.py
./kompot/anndata/__init__.py
./kompot/anndata/_da_helpers.py
./kompot/anndata/_de_helpers.py
./kompot/anndata/_legacy_differential_abundance.py
./kompot/anndata/_legacy_differential_expression.py
./kompot/anndata/cleanup.py
./kompot/anndata/differential_abundance.py
./kompot/anndata/differential_expression.py
./kompot/anndata/fdr_utils.py
./kompot/anndata/smooth.py
./kompot/anndata/utils.py
./kompot/anndata/utils/__init__.py
./kompot/anndata/utils/field_tracking.py
./kompot/anndata/utils/group_utils.py
./kompot/anndata/utils/json_utils.py
./kompot/anndata/utils/params.py
./kompot/anndata/utils/runinfo.py
./kompot/cli/__init__.py
./kompot/cli/__main__.py
./kompot/cli/compute_config.py
./kompot/cli/da.py
./kompot/cli/de.py
./kompot/cli/dm.py
./kompot/cli/main.py
./kompot/cli/smooth.py
./kompot/cli/utils.py
./kompot/cli/templates/da_config_minimal.yaml
./kompot/cli/templates/da_config_template.yaml
./kompot/cli/templates/de_config_minimal.yaml
./kompot/cli/templates/de_config_template.yaml
./kompot/cli/templates/dm_config_minimal.yaml
./kompot/cli/templates/dm_config_template.yaml
./kompot/cli/templates/smooth_config_template.yaml
./kompot/differential/__init__.py
./kompot/differential/differential_abundance.py
./kompot/differential/differential_expression.py
./kompot/differential/expression_model.py
./kompot/differential/sample_variance_estimator.py
./kompot/differential/utils.py
./kompot/plot/__init__.py
./kompot/plot/embedding.py
./kompot/plot/expression.py
./kompot/plot/field_inference.py
./kompot/plot/heatmap.py
./kompot/plot/smoothing.py
./kompot/plot/stringdb.py
./kompot/plot/volcano.py
./kompot/plot/heatmap/__init__.py
./kompot/plot/heatmap/core.py
./kompot/plot/heatmap/direction_plot.py
./kompot/plot/heatmap/utils.py
./kompot/plot/heatmap/visualization.py
./kompot/plot/volcano/__init__.py
./kompot/plot/volcano/da.py
./kompot/plot/volcano/de.py
./kompot/plot/volcano/multi_da.py
./kompot/plot/volcano/utils.py
kompot/__init__.py
kompot/batch_utils.py
kompot/fdr.py
kompot/memory_utils.py
kompot/resource_estimation.py
kompot/settings.py
kompot/utils.py
kompot/validation.py
kompot/version.py
kompot.egg-info/PKG-INFO
kompot.egg-info/SOURCES.txt
kompot.egg-info/dependency_links.txt
kompot.egg-info/entry_points.txt
kompot.egg-info/requires.txt
kompot.egg-info/top_level.txt
kompot/anndata/__init__.py
kompot/anndata/_da_helpers.py
kompot/anndata/_de_helpers.py
kompot/anndata/_legacy_differential_abundance.py
kompot/anndata/_legacy_differential_expression.py
kompot/anndata/cleanup.py
kompot/anndata/differential_abundance.py
kompot/anndata/differential_expression.py
kompot/anndata/fdr_utils.py
kompot/anndata/smooth.py
kompot/anndata/utils.py
kompot/anndata/utils/__init__.py
kompot/anndata/utils/field_tracking.py
kompot/anndata/utils/group_utils.py
kompot/anndata/utils/json_utils.py
kompot/anndata/utils/params.py
kompot/anndata/utils/runinfo.py
kompot/cli/__init__.py
kompot/cli/__main__.py
kompot/cli/compute_config.py
kompot/cli/da.py
kompot/cli/de.py
kompot/cli/dm.py
kompot/cli/main.py
kompot/cli/smooth.py
kompot/cli/utils.py
kompot/cli/templates/da_config_minimal.yaml
kompot/cli/templates/da_config_template.yaml
kompot/cli/templates/de_config_minimal.yaml
kompot/cli/templates/de_config_template.yaml
kompot/cli/templates/dm_config_minimal.yaml
kompot/cli/templates/dm_config_template.yaml
kompot/cli/templates/smooth_config_template.yaml
kompot/differential/__init__.py
kompot/differential/differential_abundance.py
kompot/differential/differential_expression.py
kompot/differential/expression_model.py
kompot/differential/sample_variance_estimator.py
kompot/differential/utils.py
kompot/plot/__init__.py
kompot/plot/embedding.py
kompot/plot/expression.py
kompot/plot/field_inference.py
kompot/plot/heatmap.py
kompot/plot/smoothing.py
kompot/plot/stringdb.py
kompot/plot/volcano.py
kompot/plot/heatmap/__init__.py
kompot/plot/heatmap/core.py
kompot/plot/heatmap/direction_plot.py
kompot/plot/heatmap/utils.py
kompot/plot/heatmap/visualization.py
kompot/plot/volcano/__init__.py
kompot/plot/volcano/da.py
kompot/plot/volcano/de.py
kompot/plot/volcano/multi_da.py
kompot/plot/volcano/utils.py