vol_labels_to_meshes — VOLCOLOR render op

• データ種: labels → table

• 呼び出し: import volcolor; volcolor.vol_labels_to_meshes(labels, ids=None, spacing=None, seed: 'int' = 0, level: 'float' = 0.5, axes: 'str' = 'xyz') (または opsvolcolor.get("vol_labels_to_meshes"))

使い方

成分ごとに marching cubes をかけ、色付きメッシュの集合にする。

返りは `list[dict]、各要素が `{"label", "vertices" (nv, 3) float64,

"faces" (nf, 3) int64, "color" (r, g, b)}``。色は

:func:vol_colorize_labels と同じパレットなので、**断面図と 3-D 表示で同じ

部品が同じ色**になる。

成分ごとに bbox を 1 ボクセル分パディングした部分体だけを切り出して

marching cubes を回す(全ボリュームを成分数だけ舐めない)。パディングは

ボリューム端に接する成分の面を閉じるためで、これをしないと端の成分だけ

穴の開いたメッシュになる。

`axes`:

• `"xyz"(既定)―― 頂点を (x, y, z) で返す。:mod:render3d` /

:mod:mesh の頂点順がこれで、`render3d.render_mesh` へ直接渡せる。

• `"zyx" ―― ボリュームの添字順のまま返す。:func:vol_label_shape_stats`

の `centroid` と同じ並びになる。

黙って取り違えると例外は出ない ―― 出るのは上下と前後が入れ替わった、

それらしい絵である。`tests/test_volcolor.py::test_mesh_axes_order_is_explicit` が

両方の重心を stats の重心と突き合わせて固定している。

*spacing* を渡すと頂点は物理座標(mm)になる。*ids* で成分を絞れる

(`None なら実在する全ラベル、ただし :data:MAX_MESHES` 件まで)。

Raises `ImportError (with the pip install scikit-image` message) when

marching cubes is unavailable, and `ValueError` for a bad *axes*, a *level*

outside `(0, 1)`, an *ids* naming an absent label, or more than

:data:MAX_MESHES components.

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。

• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。

• アルゴリズムの正典(著者・年)と用途は上記ファミリ使い方ガイドに記載。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• voxel_labels_color — py -3.11 examples/voxel_labels_color.py

型が繋がる次の op(table を入力に取れる)

—

同カテゴリ(render)

vol_label_volume_render

*Provenance: volcolor.py — VOLCOLOR operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。*

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