{% from "bootstrap.html" import css, custom_css %} Clinical Genomics Report - {{ case }} {{ css() }} {{ custom_css() }}

Leveransrapport Clinical Genomics

Kontakt Clinical Genomics

Clinical Genomics
Science for Life Laboratory
Tomtebodavägen 23
171 65 Solna
P: (08) 524 81 500

Kundinformation

{{ customer_invoice_address|replace('\n', '
')|safe }}
{% if accredited %}
SWEDAC logo
{% endif %}
{% for sample in samples %} {% endfor %}
Prov Beställt Familj Kön Status Vävnad Ticket Applikation Bioinformatisk Analys
{{ sample.name }}* ({{ sample.internal_id }}) {{ sample.ordered_at }} {{ case }}* {{ sample.sex }}* ( analys: {% if sample.sex != sample.analysis_sex %} {{ sample.analysis_sex }} {% else %} {{ sample.analysis_sex }} {% endif %}) {{ sample.status }}* {{ sample.source }}* {{ sample.ticket }} {{ sample.application }}* {{ sample.data_analysis }}*
{% for sample in samples %} {% endfor %}
Prov Ankom Biblioteksberedning Beredd Bait Set Sekvensering Sekvenserad Bioinformatisk Analys Svarsdatum
{{ sample.name }}* {{ sample.received_at }} {{ sample.prep_method }} {{ sample.prepared_at }} {{ sample.capture_kit }} {{ sample.sequencing_method }} {{ sample.sequenced_at }} {{ pipeline }} {{ sample.delivered_at }} {% if sample.processing_time != 'N/A' %} ({{ sample.processing_time }} dagar) {% endif %}
Familj MIP-version Genpaneler Genomversion
{{ case }}* {{ pipeline_version }} {{ panels }} {{ genome_build }}
{% for sample in samples %} {% endfor %}
Resultat baserade på valda genpaneler - {{ panels }}.
Prov Läspar [M] Mappade sekvenser [%] Medelsekvensdjup Täckningsgrad 10x [%] Duplikat [%]
{{ sample.name }}* {{ sample.million_read_pairs }} {{ sample.mapped_reads }} {{ sample.target_coverage }} {{ sample.target_completeness }} {{ sample.duplicates }}
* Information given av kund
{% if scout_access %}

Varianter finns uppladdade i Scout: scout.scilifelab.se/{{ customer_internal_id }}/{{ case }}

{% endif %} {% for application in applications %}

Teknisk beskrivning av analysen: {{ application.tag }}

{{ application.description }}

{% if application.limitations %}

Begränsningar av analysen: {{ application.tag }}

{{ application.limitations }}

{% endif %}
{% endfor %}

Signatur för godkännande av rapport

Valtteri Wirta
Head of unit, Clinical Genomics

Laboratoriet har inte haft ansvar för provtagningsstadiet och extraktion, resultaten gäller för provet såsom det har mottagits.
All kommunikation gällande ordern såsom tillägg, avvikelser eller ev undantag i metoden från Clinical Genomics finns tillgängligt i SupportSystem för detta ticket id. En stängd ticket kan närsomhelst öppnas upp igen för frågor.