>gapit|db=vch_vf|gene=ctxA|acc=YP_004286240.1|func=virulence cholera enterotoxin catalytic subunit CtxA
ATGGTAAAGATAATATTTGTGTTTTTTATTTTCTTATCATCATTTTCATATGCAAATGAT
GATAAGTTATATCGGGCAGATTCTAGACCTCCTGATGAAATAAAGCAGTCAGGTGGTCTT
ATGCCAAGAGGACAGAGTGAGTACTTTGACCGAGGTACTCAAATGAATATCAACCTTTAT
GATCATGCAAGAGGAACTCAGACGGGATTTGTTAGGCACGATGATGGATATGTTTCCACC
TCAATTAGTTTGAGAAGTGCCCACTTAGTGGGTCAAACTATATTGTCTGGTCATTCTACT
TATTATATATATGTTATAGCCACTGCACCCAACATGTTTAACGTTAATGATGTATTAGGG
GCATACAGTCCTCATCCAGATGAACAAGAAGTTTCTGCTTTAGGTGGGATTCCATACTCC
CAAATATATGGATGGTATCGAGTTCATTTTGGGGTGCTTGATGAACAATTACATCGTAAT
AGGGGCTACAGAGATAGATATTACAGTAACTTAGATATTGCTCCAGCAGCAGATGGTTAT
GGATTGGCAGGTTTCCCTCCGGAGCATAGAGCTTGGAGGGAAGAGCCGTGGATTCATCAT
GCACCGCCGGGTTGTGGGAATGCTCCAAGATCATCGATGAGTAATACTTGCGATGAAAAA
ACCCAAAGTCTAGGTGTAAAATTCCTTGACGAATACCAATCTAAAGTTAAAAGACAAATA
TTTTCAGGCTATCAATCTGATATTGATACACATAATAGAATTAAGGATGAATTATGA
>gapit|db=vch_vf|gene=ctxB_classical|acc=YP_004286241.1|func=virulence cholera enterotoxin binding subunit CtxB (classical allele)
ATGATTAAATTAAAATTTGGTGTTTTTTTTACAGTTTTACTATCTTCAGCATATGCACAT
GGAACACCTCAAAATATTACTGATTTGTGTGCAGAATACCACAACACACAAATACATACG
CTAAATGATAAGATATTTTCGTATACAGAATCTCTAGCTGGAAAAAGAGAGATGGCTATC
ATTACTTTTAAGAATGGTGCAACTTTTCAAGTAGAAGTACCAGGTAGTCAACATATAGAT
TCACAAAAAAAAGCGATTGAAAGGATGAAGGATACCCTGAGGATTGCATATCTTACTGAA
GCTAAAGTCGAAAAGTTATGTGTATGGAATAATAAAACGCCTCATGCGATTGCCGCAATT
AGTATGGCAAATTAA
>gapit|db=vch_vf|gene=ctxB_eltor|acc=WP_000593522.1|func=virulence cholera enterotoxin binding subunit CtxB (El Tor allele)
ATGATTAAATTAAAATTTGGTGTTTTTTTTACAGTTTTACTATCTTCAGCATATGCACAT
GGAACACCTCAAAATATTACTGATTTGTGTGCAGAATACCACAACACACAAATATATACG
CTAAATGATAAGATATTTTCGTATACAGAATCTCTAGCTGGAAAAAGAGAGATGGCTATC
ATTACTTTTAAGAATGGTGCAATTTTTCAAGTAGAAGTACCAGGTAGTCAACATATAGAT
TCACAAAAAAAAGCGATTGAAAGGATGAAGGATACCCTGAGGATTGCATATCTTACTGAA
GCTAAAGTCGAAAAGTTATGTGTATGGAATAATAAAACGCCTCATGCGATTGCCGCAATT
AGTATGGCAAATTAA
>gapit|db=vch_vf|gene=zot|acc=YP_004286239.1|func=virulence zonula occludens toxin Zot
ATGAGTATCTTTATTCATCACGGCGCGCCAGGCTCTTATAAAACGTCAGGGGCATTATGG
CTTCGTCTGCTGCCGGCGATTAAGTCAGGCCGTCACATCATCACGAATGTGCGAGGCTTA
AACCTTGAACGCATGGCTAAGTACTTAAAAATGGATGTCTCGGACATCAGTATCGAGTTT
ATTGATACAGACCATCCTGACGGTCGCTTAACGATGGCGCGTTTTTGGCACTGGGCGAGA
AAGGACGCGTTTCTCTTTATCGATGAATGTGGTCGCATCTGGCCGCCGAGACTGACGGTC
ACCAATTTAAAGGCGCTCGACACGCCGCCGGATTTGGTCGCAGAGGATAGGCCGGAGAGC
TTTGAGGTGGCTTTTGACATGCATCGTCACCACGGCTGGGATATCTGCCTAACCACGCCT
AACATTGCCAAAGTGCACAACATGATAAGAGAGGCGGCGGAGATAGGGTATCGCCACTTT
AACCGCGCCACCGTGGGGCTAGGGGCAAAGTTTACCCTGACCACCCATGATGCAGCCAAC
TCTGGACAGATGGACTCGCACGCGCTGACACGCCAAGTCAAAAAAATTCCAAGTCCGATT
TTTAAGATGTACGCAAGCACCACGACAGGCAAAGCACGCGACACGATGGCCGGAACGGCG
CTGTGGAAAGACAGAAAGATCCTTTTCTTGTTCGGCATGGTTTTTTTGATGTTCTCTTAT
TCGTTTTACGGCTTACACGACAATCCAATTTTTACAGGGGGAAATGATGCAACTATCGAG
TCAGAGCAATCCGAGCCTCAGTCAAAGGCTACTGTTGGGAATGCTGTCGGGAGCAAGGCG
GTTGCTCCTGCGTCTTTTGGTTTTTGTATTGGTCGGCTTTGTGTCCAAGATGGTTTTGTC
ACTGTTGGTGATGAGCGTTATCGCCTCGTAGACAATTTGGACATTCCTTATCGTGGTCTA
TGGGCGACAGGTCATCACATTTACAAGGATACGCTTACAGTGTTTTTTGAAACCGAGAGT
GGCAGCGTCCCAACAGAGCTGTTTGCATCGAGCTACCGCTACAAGGTGCTACCGTTACCG
GATTTCAATCACTTTGTGGTGTTCGATACCTTTGCAGCGCAAGCGCTGTGGGTAGAAGTG
AAACGGGGTTTACCGATAAAAACAGAAAATGATAAAAAAGGACTAAATAGTATATTTTGA
>gapit|db=vch_vf|gene=ace|acc=YP_004286238.1|func=virulence accessory cholera enterotoxin Ace
GTGATGCTTATGATGGACACCCTTTATGACTGGCTAATTGATGGCTTTACGTGGCTTGTG
ATCAAGCTCGGTATTATGTGGATTGAGAGCAAGATTTTTGTTATCCAATTCTTCTGGGAG
ATGTCCCAGAAAGTGATTGATATGTTTACCATCTATCCGCTTATCCAACAGGCTATCGAT
ATGCTGCCTCCTCAATACAGCGGCTTTCTGTTCTTTTTAGGGTTAGACCAAGCGCTGGCT
ATCGTGCTTCAGGCTTTGATGACCCGTTTTGCCCTGCGAGCGTTAAACCTATGA
>gapit|db=vch_vf|gene=cep|acc=YP_004286236.1|func=virulence core-encoded pilin Cep
ATGTTTAGCTCACTGAAAAACAAACTTAATACCTTTAAAAGCACGCTTTCACTCGGGGTT
TTCTTGCTGTTTTCCGCATTTGCTAACCAAGCACTCGCGGCTGCTGATGCGGGTTTGGTC
ACGGAAGTCACCAAAACACTGGGCACCAGTAAAGATACGGTGATTGCGCTTGGGCCGCTC
ATCATGGGCGTGGTGGGGGCAATTGTTCTGATTGTTACCGTGATTGGCTTAATTCGTAAG
GCTAAATAG
>gapit|db=vch_vf|gene=orfU|acc=YP_004286237.1|func=virulence minor coat protein pIII (OrfU)
GTGGCTGGGTCTCTTTGGCTCAGCGGTCATCATTATCGGCTTTGTGTCGGGCTTATATTT
GGTTTAAGGGAGGAGGGCGAGCGTTCGCCCTTTTTTATGCGCTATTTTCTACTGTTTTTG
ACATTGCTCTTTCTTTCTCCATCGGTAACGGCTTCCGCCATCAATTGTGATCCTAATACT
ACTACGTCACACCAGTTACTTTTCGGTTTTGGCTCTCCCATTGTGCAATCGGTGTTATTT
GATGGCTGCATGCTTGATATTGAAAAAGATGACTATGGTTTTGTTTGGTCTTGTCTCTCA
AATGAAAATGGGGACTATTGCAAGGGGCTCTACAAACCCCGTTTTTCACAAGGGGTATCC
CCGAACTGGCCGATGTGCGACTTGTCCGGAGCATCTGCAGAGCGCTGCATTTATCCTTAT
TGCCCTGAGGGGGAAGAGTGCGTTCCCTTACCACCTTCACCGCCCAGTGATTCCCCTGTT
GATGGGCTGAGCAGCTCGTTTAAGTCTGCGTTCAATCAGGTCTATAAAAACCAATCAGAG
ATGGCTTCGACTCTCAATCATGTCAGTGGTCAGGTGTCCCACTCTCAAGATATGGTTCAG
CTCAATACGAAGTTTCACGCGGATCGTGTTCTTGAGAGTGTCACCGCAGTCAACAATCGT
TTGGGTGGGCAAATGGAGTATCTTGAGGAAATCCGCATTGATGTTTGGGATACGCAACGG
GAGGTAAGAAAAGCCAAGGATGAGCTTTACTCTCGTGTTGCGGCTGTTTCATACGATGTG
CTTTATAGCGAGCTTAATGTCCTTCGGGCGATTGATGAACTTAAAGACTCACTCGGTGGG
ACTGTCGTTCCGCCTAACCCAGACCAACCCAATCCCACGCCACCCGATAGCAGCAGCCCC
AATTATACAGGGGCGCTTAATACCATCTCTAAAAAGCTCAATACCTTAGAGACGATTTCA
CAGCAACTCGACACCATGAACACGGCGCTATCAGGGCGCTGTAGTAACCCTGAACGCTGT
CAGTTTCCGATACGAGAGGCCGAGACCGAGTTAGAAACGGCTCAGCAGAATTTAAAGCAG
ATGATCAACGAGAAAATCACCCAGTCGGCTTTGCATCAGTTCAAAGGCTCGGCGGCGGTG
CCTTCGTTTTGCTCCTATGTCGAGGCGTTTGGTTACAACCTCTGTTTTGACTTCTCCCTC
TTTTCTGAAAACCTGCACATCATCCGCATGATAGTGCTCGCGATGGCGTACATTCTGGCC
GCCATGCTCATTTTGTTTAGGTGA
>gapit|db=vch_vf|gene=rstR|acc=YP_004286229.1|func=virulence CTXphi transcriptional repressor RstR
ATGAAGATAAAAGAAAGGCTAGCCAACCAAAGAAAGGCAATTAATAAGACTCAGGCACAA
ATGGCTGATGAAATTGGAATTAGTCTAACATCGTACAAAAAATACGAATCTGGGGAAGGT
TTGCCTACAATGGAAAACCTTGTGAAGATCGCAGATGCTCTGGAGATCTCAATTGATGAA
CTATGCGGAAGATGGGCCACAGATGAAAATCAAGAGCTTATGCTCAGGTTAAAAAAAATC
CAACAGTTAGATGAAGAAGAGCAAAAAGCAATAAGCATGGTTTTAGAAAGTATGCTGATA
AGACATTCTACCAAGAGCATCTTAAATCATGGTGCTTAG
>gapit|db=vch_vf|gene=rstA|acc=YP_004286230.1|func=virulence CTXphi replication initiation factor RstA
ATGAAAAAGCAGATTTTCACTCTTGACGAATTACAACTCGATACAAACGCTTCTCCGTTT
GTTTTTGTCGATTATCTTGCTTGGTCGGTTCCTTATGCTTCATTCCGTCACGCGCATAAG
TCCGATTTGTCCTCGCTTATCTGGGCGCCTCTTCCTAAGCCCGATTACCGTATGGCTCGC
ACCCCTGAGCAAAAAGAGAAGTTAATCGAGCTTTATAAGCAGAAGTGGAACGTTGCCATG
ATGGAACGCTTGGAGGTGTTTTGCCTTCATGTTCTTGGTCTTCGTATGTCGCCTTGGCGC
GATAAGGGGCTTTATGGGTATGAAAACTCATGCCATTTGATGTCGAAGTACTCCAATAAA
CACGTGGGCTTTGTTGCGCTAGGGGGAAACCGTAATACCTGTTACTTCCAAATTGAGGGA
GTAGGGTGTCGAACCGTGTTAGAGCACACCTCTTTATTCCGTCTTCATTGGTGGCTCGAT
TTATTAGGTTGCTCTCGTCTGTCTCGTATTGATTTGGCCGTTGATGACTTTCACGGTTTA
TTTGGCCGTGAGTACGCCAAAAAAGCCTATTCCGATGATGCCTTTCGCACCGCTAGAGCG
GGACGTGCTCCTAACGGTGGTGAGCGATTAGTCTCTGAGCCTAATGGCAAAATCATCAAT
GAATCTTTCGAGGTAGGCTCTCGTGAATCTCGCATTTACTGGCGTATCTACAACAAGGCT
GCTCAGCTTGGTTTAGATATGCACTGGTTTCGTAATGAGGTCGAGCTTAAAGACATGCCT
ATCGACGTTCTGCTCAATATCGAGGGGTATTTTGCAGGTTTGTGCGCGTACTCGGCCTCA
ATTATCAATTCCTTGCCTGTCAAGGTGGTCACAAAAAAGCGTCAAGTGGCGCTTGATATC
CACTCACGCATTAAGTGGGCTCGTCGCCAGGTTGGTAAGACTTTGTTTGATATTTCAAAG
CATTTTGGTGGTGATTTGGAAAGGGTGTTTGGGGCGTTGATTTCTAAGGAAATTCACGAC
GATTCACTCAACCTTCCAGATTCTTATATGAAGTTAATTGATGAAATTATGGGTGATTAA
>gapit|db=vch_vf|gene=rstB|acc=YP_004286231.1|func=virulence CTXphi RstB
TTGATGAAATTATGGGTGATTAATATGAAATCTCGTTTTGTTGTTTTTGGTGCCTCTCAT
TCTGAAGGGGTGAGTAAGACTGGTGCTCCTTACCTTATCCCAGTACTTTTTGTTGGTAAG
CCGATTCGCCAGTGGAAAAACGATAAAGGCCAATGTTTGACGTTTGGCTTGCAGCATCAG
GAAGTGAAGTTTGTATCCAGTGACGCGATGACCAGAAAACTCGAACAGACCGCCTTTCCG
GTTCTTGTCACGTTTGACAATGAGCCAGACCCAGAAGACCCATCACGCAACCTCGTGATT
GATTATCAAGTGGTGTGTTCCTTGTTTGACAACGTGCCGGGCGGCAAGCCATTGGATAAG
CCTAACAAAATCTAG
>gapit|db=vch_vf|gene=tcpA_classical|acc=WP_001176378.1|func=virulence toxin-coregulated pilus major pilin TcpA (classical allele)
ATGCAATTATTAAAACAGCTTTTTAAGAAGAAATTTGTAAAAGAAGAACACGATAAGAAA
ACCGGTCAAGAGGGTATGACATTACTCGAAGTGATCATCGTTCTAGGCATTATGGGGGTG
GTTTCGGCGGGGGTTGTTACTCTGGCGCAGCGTGCGATTGATTCGCAGAATATGACCAAG
GCCGCGCAAAGTCTCAATAGTATCCAAGTTGCACTGACACAGACATACCGTGGTCTAGGT
AATTATCCAGCAACAGCTGATGCGACAGCTGCTAGTAAGCTAACTTCAGGCTTGGTTAGT
TTAGGTAAAATATCATCCGATGAGGCAAAAAACCCATTCATTGGTACAAATATGAATATT
TTTTCATTTCCGCGTAATGCAGCAGCTAATAAAGCATTTGCAATTTCAGTGGATGGTCTG
ACACAGGCTCAATGCAAGACACTTATTACCAGTGTCGGTGATATGTTCCCATATATTGCA
ATCAAAGCTGGTGGCGCAGTAGCACTTGCAGATCTAGGTGATTTTGAGAATTCTGCAGCA
GCGGCTGAGACAGGCGTTGGTGTGATCAAATCTATCGCTCCCGCTAGTAAGAATTTAGAT
CTAACGAACATCACTCACGTTGAGAAATTATGTAAAGGTACTGCTCCATTCGGCGTTGCA
TTTGGTAACAGCTAA
>gapit|db=vch_vf|gene=tcpA_eltor|acc=WP_001176374.1|func=virulence toxin-coregulated pilus major pilin TcpA (El Tor allele)
ATGCAATTATTAAAACAGCTTTTTAAGAAGAAGTTTGTAAAAGAAGAACACGATAAGAAA
ACCGGTCAAGAGGGTATGACATTACTCGAAGTAATCATTGTTCTGGGTATTATGGGTGTG
GTCTCAGCGGGTGTTGTTACGCTGGCTCAGCGTGCGATTGATTCGCAGAATATGACTAAG
GCTGCGCAAAATCTAAACAGCGTGCAAATTGCAATGACACAAACTTATCGTAGTCTTGGT
AATTATCCAGCTACCGCAAACGCAAATGCTGCTACACAGCTAGCTAATGGTTTGGTCAGC
CTTGGTAAGGTTTCAGCTGATGAGGCAAAGAATCCTTTCACTGGTACAGCTATGGGGATT
TTCTCATTTCCACGAAACTCTGCAGCGAATAAAGCATTCGCAATTACAGTCGGTGGCTTG
ACCCAAGCACAATGTAAGACTTTGGTTACAAGCGTAGGGGATATGTTTCCATTTATCAAC
GTGAAAGAAGGTGCTTTCGCTGCTGTCGCTGATCTTGGTGATTTCGAAACGAGTGTCGCA
GATGCTGCTACTGGCGCTGGCGTAATTAAGTCCATTGCACCAGGAAGTGCCAACTTAAAC
CTAACTAATATCACGCATGTTGAGAAGCTTTGTACAGGAACTGCTCCATTCACAGTAGCT
TTTGGTAACAGTTAA
>gapit|db=vch_vf|gene=tcpA_o139|acc=WP_050926100.1|func=virulence toxin-coregulated pilus major pilin TcpA (O139-associated variant)
ATGCAATTATTAAAACAGCTTTTTAAGAAGAAGTTTGTAAAAGAAGAACACGATAAGAAA
ACCGGTCAAGAGGGTATGACATTACTCGAAGTAATCATTGTTCTGGGTATTATGGGTGTG
GTCTCAGCGGGTGTTGTTACGCTGGCTCAGCGTGCGATTGATTCGCAGAATATGACTAAG
GCTGCGCAAAATCTAAACAGCGTGCAAATTGCAATGACACAAACTTATCGTAGTCTTGGT
AATTATCCAGCTACCGCAGACGCAAATGCTGCTACACAGCTAGCTAATGGTTTGGTCAGC
CTTGGTAAGGTTTCAGCTGATGAGGCAAAGAATCCTTTCACTGGTACAGCTATGGGGATT
TTCTCATTTCCACGAAACTCTGCAGCGAATAAAGCATTCGCAATTACAGTCGGTGGCTTG
ACCCAAGCACAATGTAAGACTTTGGTTACAAGCGTAGGGGATATGTTTCCATTTATCAAC
GTGAAAGAAGGTGCTTTCGCTGCTGTCGCTGATCTTGGTGATTTCGAAACGAGTGTCGCA
AATGCTGCTACTGGCGCTGGCGTAATTAAGTCCATTGCACCAGGAAGTGCCAACTTAAAC
CTAACTAATATCACGCATGTTGAGAAGCTTTGTACAGGAACTGCTCCATTCACAGTAGCT
TTTGGTAACAGTTAA
