Select a Metric: | Select a Category: |
Show Categories:
Legend▶ | ■ | AACTCGTCGATG | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | AACTGTGCGTAC | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | ACAGACCACTCA | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | ACAGAGTCGGCT | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
▶ | ■ | ACCAGCGACTAG | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | ACCGCAGAGTCA | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
▶ | ■ | ACGGTGAGTGTC | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | AGCACGAGCCTA | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
▶ | ■ | AGCAGCACTTGT | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | 20061126 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | 20061218 | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | 20070314 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | 20071112 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | 20071210 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | 20080116 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._354 | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._355 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._356 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._481 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._593 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._607 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._634 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._635 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._636 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
▶ | ■ | PC.355 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | PC.356 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | PC.481 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | PC.593 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | PC.607 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
▶ | ■ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
▶ | ■ | PC.636 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | Control | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | Fast | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | AACTCGTCGATG | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | AACTGTGCGTAC | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | ACAGACCACTCA | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | ACAGAGTCGGCT | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
▶ | ■ | ACCAGCGACTAG | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | ACCGCAGAGTCA | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
▶ | ■ | ACGGTGAGTGTC | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | AGCACGAGCCTA | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
▶ | ■ | AGCAGCACTTGT | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | 20061126 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | 20061218 | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | 20070314 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | 20071112 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | 20071210 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | 20080116 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._354 | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._355 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._356 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._481 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._593 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._607 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._634 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._635 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._636 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
▶ | ■ | PC.355 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | PC.356 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | PC.481 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | PC.593 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | PC.607 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
▶ | ■ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
▶ | ■ | PC.636 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | Control | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | Fast | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | AACTCGTCGATG | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | AACTGTGCGTAC | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | ACAGACCACTCA | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | ACAGAGTCGGCT | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
▶ | ■ | ACCAGCGACTAG | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | ACCGCAGAGTCA | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
▶ | ■ | ACGGTGAGTGTC | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | AGCACGAGCCTA | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
▶ | ■ | AGCAGCACTTGT | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | 20061126 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | 20061218 | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | 20070314 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | 20071112 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | 20071210 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | 20080116 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._354 | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._355 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._356 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._481 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | Control_mouse_I.D._593 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._607 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._634 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._635 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
▶ | ■ | Fasting_mouse_I.D._636 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
▶ | ■ | PC.355 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
▶ | ■ | PC.356 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
▶ | ■ | PC.481 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
▶ | ■ | PC.593 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | PC.607 | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
▶ | ■ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
▶ | ■ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
▶ | ■ | PC.636 | |
∟ | ◆ | PC.636 | |
▶ | ■ | Control | |
∟ | ◆ | PC.354 | |
∟ | ◆ | PC.355 | |
∟ | ◆ | PC.356 | |
∟ | ◆ | PC.481 | |
∟ | ◆ | PC.593 | |
▶ | ■ | Fast | |
∟ | ◆ | PC.607 | |
∟ | ◆ | PC.634 | |
∟ | ◆ | PC.635 | |
∟ | ◆ | PC.636 |
Description | Seqs/Sample | PD_whole_tree Ave. | PD_whole_tree Err. | chao1 Ave. | chao1 Err. | observed_species Ave. | observed_species Err. |
Control_mouse_I.D._354 | 10.0 | 1.363 | nan | 28.250 | nan | 8.300 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 19.0 | 1.803 | nan | 31.533 | nan | 12.700 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 28.0 | 2.050 | nan | 58.408 | nan | 17.700 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 37.0 | 2.570 | nan | 92.600 | nan | 21.600 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 46.0 | 2.740 | nan | 104.708 | nan | 26.200 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 55.0 | 3.106 | nan | 174.483 | nan | 30.900 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 64.0 | 3.265 | nan | 175.815 | nan | 33.700 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 73.0 | 3.606 | nan | 140.712 | nan | 36.600 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 82.0 | 3.870 | nan | 111.559 | nan | 39.800 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 91.0 | 4.073 | nan | 184.542 | nan | 42.700 | nan |
Control_mouse_I.D._354 | 100.0 | 4.345 | nan | 155.064 | nan | 46.700 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 10.0 | 1.354 | nan | 23.200 | nan | 8.300 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 19.0 | 1.713 | nan | 51.050 | nan | 14.500 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 28.0 | 2.261 | nan | 60.057 | nan | 19.100 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 37.0 | 2.393 | nan | 81.785 | nan | 22.800 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 46.0 | 2.599 | nan | 120.280 | nan | 28.900 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 55.0 | 2.749 | nan | 127.919 | nan | 32.100 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 64.0 | 3.067 | nan | 100.930 | nan | 35.200 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 73.0 | 3.227 | nan | 111.347 | nan | 38.300 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 82.0 | 3.440 | nan | 89.824 | nan | 41.500 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 91.0 | 3.583 | nan | 100.172 | nan | 44.600 | nan |
Control_mouse_I.D._355 | 100.0 | 3.813 | nan | 125.530 | nan | 49.200 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 10.0 | 1.262 | nan | 25.800 | nan | 8.400 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 19.0 | 2.063 | nan | 85.750 | nan | 16.300 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 28.0 | 2.361 | nan | 106.783 | nan | 22.100 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 37.0 | 2.540 | nan | 95.093 | nan | 28.000 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 46.0 | 2.966 | nan | 176.074 | nan | 33.400 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 55.0 | 3.379 | nan | 145.933 | nan | 38.900 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 64.0 | 3.539 | nan | 157.168 | nan | 43.800 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 73.0 | 3.935 | nan | 159.373 | nan | 48.500 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 82.0 | 3.943 | nan | 161.406 | nan | 51.700 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 91.0 | 4.301 | nan | 239.934 | nan | 58.400 | nan |
Control_mouse_I.D._356 | 100.0 | 4.471 | nan | 183.857 | nan | 61.100 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 10.0 | 1.299 | nan | 32.000 | nan | 8.800 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 19.0 | 2.323 | nan | 68.900 | nan | 16.400 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 28.0 | 2.564 | nan | 75.958 | nan | 21.800 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 37.0 | 3.191 | nan | 87.155 | nan | 29.100 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 46.0 | 3.518 | nan | 143.428 | nan | 35.300 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 55.0 | 4.037 | nan | 151.184 | nan | 39.900 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 64.0 | 4.186 | nan | 154.661 | nan | 43.200 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 73.0 | 4.320 | nan | 135.267 | nan | 46.600 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 82.0 | 4.743 | nan | 238.448 | nan | 53.000 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 91.0 | 5.039 | nan | 200.001 | nan | 57.100 | nan |
Control_mouse_I.D._481 | 100.0 | 5.418 | nan | 209.870 | nan | 62.200 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 10.0 | 1.651 | nan | 20.900 | nan | 7.900 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 19.0 | 2.247 | nan | 38.933 | nan | 13.800 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 28.0 | 2.609 | nan | 44.317 | nan | 17.000 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 37.0 | 2.895 | nan | 48.384 | nan | 20.500 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 46.0 | 3.016 | nan | 50.042 | nan | 23.500 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 55.0 | 3.439 | nan | 67.744 | nan | 26.600 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 64.0 | 3.451 | nan | 62.245 | nan | 27.600 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 73.0 | 3.769 | nan | 65.043 | nan | 30.700 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 82.0 | 3.939 | nan | 66.905 | nan | 33.500 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 91.0 | 4.080 | nan | 70.952 | nan | 35.000 | nan |
Control_mouse_I.D._593 | 100.0 | 4.181 | nan | 79.656 | nan | 37.000 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 10.0 | 1.910 | nan | 29.833 | nan | 8.800 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 19.0 | 2.534 | nan | 38.960 | nan | 15.000 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 28.0 | 3.134 | nan | 66.758 | nan | 20.700 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 37.0 | 3.548 | nan | 73.808 | nan | 26.500 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 46.0 | 4.206 | nan | 101.362 | nan | 32.900 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 55.0 | 4.408 | nan | 130.980 | nan | 35.800 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 64.0 | 4.916 | nan | 154.486 | nan | 40.900 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 73.0 | 5.351 | nan | 147.368 | nan | 45.900 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 82.0 | 5.357 | nan | 181.234 | nan | 49.200 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 91.0 | 5.794 | nan | 166.101 | nan | 54.300 | nan |
Fasting_mouse_I.D._607 | 100.0 | 5.912 | nan | 210.383 | nan | 56.800 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 10.0 | 1.878 | nan | 25.650 | nan | 8.300 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 19.0 | 2.697 | nan | 42.650 | nan | 14.900 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 28.0 | 3.218 | nan | 66.412 | nan | 19.300 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 37.0 | 3.854 | nan | 78.960 | nan | 25.400 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 46.0 | 4.092 | nan | 82.099 | nan | 28.800 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 55.0 | 4.539 | nan | 83.282 | nan | 32.100 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 64.0 | 4.715 | nan | 98.698 | nan | 35.100 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 73.0 | 5.187 | nan | 96.537 | nan | 40.700 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 82.0 | 5.338 | nan | 107.788 | nan | 42.900 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 91.0 | 5.643 | nan | 120.012 | nan | 48.000 | nan |
Fasting_mouse_I.D._634 | 100.0 | 5.699 | nan | 109.366 | nan | 49.100 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 10.0 | 1.915 | nan | 45.400 | nan | 9.700 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 19.0 | 2.667 | nan | 106.600 | nan | 17.400 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 28.0 | 3.101 | nan | 80.500 | nan | 22.600 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 37.0 | 3.716 | nan | 105.833 | nan | 30.700 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 46.0 | 4.131 | nan | 182.311 | nan | 36.600 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 55.0 | 4.552 | nan | 170.839 | nan | 40.800 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 64.0 | 4.969 | nan | 166.744 | nan | 46.900 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 73.0 | 5.392 | nan | 175.437 | nan | 52.800 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 82.0 | 5.601 | nan | 191.788 | nan | 56.100 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 91.0 | 5.909 | nan | 235.229 | nan | 61.500 | nan |
Fasting_mouse_I.D._635 | 100.0 | 6.219 | nan | 243.876 | nan | 66.700 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 10.0 | 1.968 | nan | 18.450 | nan | 7.900 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 19.0 | 2.340 | nan | 43.850 | nan | 12.600 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 28.0 | 2.977 | nan | 61.942 | nan | 17.700 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 37.0 | 3.264 | nan | 83.258 | nan | 21.800 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 46.0 | 3.665 | nan | 85.742 | nan | 25.100 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 55.0 | 4.098 | nan | 80.079 | nan | 30.000 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 64.0 | 4.293 | nan | 103.408 | nan | 33.000 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 73.0 | 4.389 | nan | 132.945 | nan | 36.400 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 82.0 | 5.018 | nan | 124.191 | nan | 42.300 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 91.0 | 4.962 | nan | 124.116 | nan | 42.800 | nan |
Fasting_mouse_I.D._636 | 100.0 | 5.331 | nan | 168.212 | nan | 47.900 | nan |
DOB | Seqs/Sample | PD_whole_tree Ave. | PD_whole_tree Err. | chao1 Ave. | chao1 Err. | observed_species Ave. | observed_species Err. |
20061126 | 10.0 | 1.262 | nan | 25.800 | nan | 8.400 | nan |
20061126 | 19.0 | 2.063 | nan | 85.750 | nan | 16.300 | nan |
20061126 | 28.0 | 2.361 | nan | 106.783 | nan | 22.100 | nan |
20061126 | 37.0 | 2.540 | nan | 95.093 | nan | 28.000 | nan |
20061126 | 46.0 | 2.966 | nan | 176.074 | nan | 33.400 | nan |
20061126 | 55.0 | 3.379 | nan | 145.933 | nan | 38.900 | nan |
20061126 | 64.0 | 3.539 | nan | 157.168 | nan | 43.800 | nan |
20061126 | 73.0 | 3.935 | nan | 159.373 | nan | 48.500 | nan |
20061126 | 82.0 | 3.943 | nan | 161.406 | nan | 51.700 | nan |
20061126 | 91.0 | 4.301 | nan | 239.934 | nan | 58.400 | nan |
20061126 | 100.0 | 4.471 | nan | 183.857 | nan | 61.100 | nan |
20061218 | 10.0 | 1.358 | 0.004 | 25.725 | 2.525 | 8.300 | nan |
20061218 | 19.0 | 1.758 | 0.045 | 41.292 | 9.758 | 13.600 | 0.900 |
20061218 | 28.0 | 2.156 | 0.106 | 59.233 | 0.824 | 18.400 | 0.700 |
20061218 | 37.0 | 2.481 | 0.089 | 87.192 | 5.407 | 22.200 | 0.600 |
20061218 | 46.0 | 2.670 | 0.070 | 112.494 | 7.786 | 27.550 | 1.350 |
20061218 | 55.0 | 2.927 | 0.179 | 151.201 | 23.282 | 31.500 | 0.600 |
20061218 | 64.0 | 3.166 | 0.099 | 138.373 | 37.443 | 34.450 | 0.750 |
20061218 | 73.0 | 3.416 | 0.190 | 126.029 | 14.682 | 37.450 | 0.850 |
20061218 | 82.0 | 3.655 | 0.215 | 100.692 | 10.867 | 40.650 | 0.850 |
20061218 | 91.0 | 3.828 | 0.245 | 142.357 | 42.185 | 43.650 | 0.950 |
20061218 | 100.0 | 4.079 | 0.266 | 140.297 | 14.767 | 47.950 | 1.250 |
20070314 | 10.0 | 1.299 | nan | 32.000 | nan | 8.800 | nan |
20070314 | 19.0 | 2.323 | nan | 68.900 | nan | 16.400 | nan |
20070314 | 28.0 | 2.564 | nan | 75.958 | nan | 21.800 | nan |
20070314 | 37.0 | 3.191 | nan | 87.155 | nan | 29.100 | nan |
20070314 | 46.0 | 3.518 | nan | 143.428 | nan | 35.300 | nan |
20070314 | 55.0 | 4.037 | nan | 151.184 | nan | 39.900 | nan |
20070314 | 64.0 | 4.186 | nan | 154.661 | nan | 43.200 | nan |
20070314 | 73.0 | 4.320 | nan | 135.267 | nan | 46.600 | nan |
20070314 | 82.0 | 4.743 | nan | 238.448 | nan | 53.000 | nan |
20070314 | 91.0 | 5.039 | nan | 200.001 | nan | 57.100 | nan |
20070314 | 100.0 | 5.418 | nan | 209.870 | nan | 62.200 | nan |
20071112 | 10.0 | 1.910 | nan | 29.833 | nan | 8.800 | nan |
20071112 | 19.0 | 2.534 | nan | 38.960 | nan | 15.000 | nan |
20071112 | 28.0 | 3.134 | nan | 66.758 | nan | 20.700 | nan |
20071112 | 37.0 | 3.548 | nan | 73.808 | nan | 26.500 | nan |
20071112 | 46.0 | 4.206 | nan | 101.362 | nan | 32.900 | nan |
20071112 | 55.0 | 4.408 | nan | 130.980 | nan | 35.800 | nan |
20071112 | 64.0 | 4.916 | nan | 154.486 | nan | 40.900 | nan |
20071112 | 73.0 | 5.351 | nan | 147.368 | nan | 45.900 | nan |
20071112 | 82.0 | 5.357 | nan | 181.234 | nan | 49.200 | nan |
20071112 | 91.0 | 5.794 | nan | 166.101 | nan | 54.300 | nan |
20071112 | 100.0 | 5.912 | nan | 210.383 | nan | 56.800 | nan |
20071210 | 10.0 | 1.651 | nan | 20.900 | nan | 7.900 | nan |
20071210 | 19.0 | 2.247 | nan | 38.933 | nan | 13.800 | nan |
20071210 | 28.0 | 2.609 | nan | 44.317 | nan | 17.000 | nan |
20071210 | 37.0 | 2.895 | nan | 48.384 | nan | 20.500 | nan |
20071210 | 46.0 | 3.016 | nan | 50.042 | nan | 23.500 | nan |
20071210 | 55.0 | 3.439 | nan | 67.744 | nan | 26.600 | nan |
20071210 | 64.0 | 3.451 | nan | 62.245 | nan | 27.600 | nan |
20071210 | 73.0 | 3.769 | nan | 65.043 | nan | 30.700 | nan |
20071210 | 82.0 | 3.939 | nan | 66.905 | nan | 33.500 | nan |
20071210 | 91.0 | 4.080 | nan | 70.952 | nan | 35.000 | nan |
20071210 | 100.0 | 4.181 | nan | 79.656 | nan | 37.000 | nan |
20080116 | 10.0 | 1.920 | 0.037 | 29.833 | 11.393 | 8.633 | 0.772 |
20080116 | 19.0 | 2.568 | 0.162 | 64.367 | 29.867 | 14.967 | 1.960 |
20080116 | 28.0 | 3.099 | 0.098 | 69.618 | 7.908 | 19.867 | 2.040 |
20080116 | 37.0 | 3.612 | 0.252 | 89.351 | 11.786 | 25.967 | 3.655 |
20080116 | 46.0 | 3.962 | 0.211 | 116.717 | 46.406 | 30.167 | 4.793 |
20080116 | 55.0 | 4.396 | 0.211 | 111.400 | 42.050 | 34.300 | 4.675 |
20080116 | 64.0 | 4.659 | 0.279 | 122.950 | 31.027 | 38.333 | 6.118 |
20080116 | 73.0 | 4.990 | 0.433 | 134.973 | 32.243 | 43.300 | 6.943 |
20080116 | 82.0 | 5.319 | 0.238 | 141.256 | 36.354 | 47.100 | 6.369 |
20080116 | 91.0 | 5.505 | 0.399 | 159.785 | 53.373 | 50.767 | 7.881 |
20080116 | 100.0 | 5.750 | 0.364 | 173.818 | 55.057 | 54.567 | 8.594 |
BarcodeSequence | Seqs/Sample | PD_whole_tree Ave. | PD_whole_tree Err. | chao1 Ave. | chao1 Err. | observed_species Ave. | observed_species Err. |
AACTCGTCGATG | 10.0 | 1.354 | nan | 23.200 | nan | 8.300 | nan |
AACTCGTCGATG | 19.0 | 1.713 | nan | 51.050 | nan | 14.500 | nan |
AACTCGTCGATG | 28.0 | 2.261 | nan | 60.057 | nan | 19.100 | nan |
AACTCGTCGATG | 37.0 | 2.393 | nan | 81.785 | nan | 22.800 | nan |
AACTCGTCGATG | 46.0 | 2.599 | nan | 120.280 | nan | 28.900 | nan |
AACTCGTCGATG | 55.0 | 2.749 | nan | 127.919 | nan | 32.100 | nan |
AACTCGTCGATG | 64.0 | 3.067 | nan | 100.930 | nan | 35.200 | nan |
AACTCGTCGATG | 73.0 | 3.227 | nan | 111.347 | nan | 38.300 | nan |
AACTCGTCGATG | 82.0 | 3.440 | nan | 89.824 | nan | 41.500 | nan |
AACTCGTCGATG | 91.0 | 3.583 | nan | 100.172 | nan | 44.600 | nan |
AACTCGTCGATG | 100.0 | 3.813 | nan | 125.530 | nan | 49.200 | nan |
AACTGTGCGTAC | 10.0 | 1.910 | nan | 29.833 | nan | 8.800 | nan |
AACTGTGCGTAC | 19.0 | 2.534 | nan | 38.960 | nan | 15.000 | nan |
AACTGTGCGTAC | 28.0 | 3.134 | nan | 66.758 | nan | 20.700 | nan |
AACTGTGCGTAC | 37.0 | 3.548 | nan | 73.808 | nan | 26.500 | nan |
AACTGTGCGTAC | 46.0 | 4.206 | nan | 101.362 | nan | 32.900 | nan |
AACTGTGCGTAC | 55.0 | 4.408 | nan | 130.980 | nan | 35.800 | nan |
AACTGTGCGTAC | 64.0 | 4.916 | nan | 154.486 | nan | 40.900 | nan |
AACTGTGCGTAC | 73.0 | 5.351 | nan | 147.368 | nan | 45.900 | nan |
AACTGTGCGTAC | 82.0 | 5.357 | nan | 181.234 | nan | 49.200 | nan |
AACTGTGCGTAC | 91.0 | 5.794 | nan | 166.101 | nan | 54.300 | nan |
AACTGTGCGTAC | 100.0 | 5.912 | nan | 210.383 | nan | 56.800 | nan |
ACAGACCACTCA | 10.0 | 1.262 | nan | 25.800 | nan | 8.400 | nan |
ACAGACCACTCA | 19.0 | 2.063 | nan | 85.750 | nan | 16.300 | nan |
ACAGACCACTCA | 28.0 | 2.361 | nan | 106.783 | nan | 22.100 | nan |
ACAGACCACTCA | 37.0 | 2.540 | nan | 95.093 | nan | 28.000 | nan |
ACAGACCACTCA | 46.0 | 2.966 | nan | 176.074 | nan | 33.400 | nan |
ACAGACCACTCA | 55.0 | 3.379 | nan | 145.933 | nan | 38.900 | nan |
ACAGACCACTCA | 64.0 | 3.539 | nan | 157.168 | nan | 43.800 | nan |
ACAGACCACTCA | 73.0 | 3.935 | nan | 159.373 | nan | 48.500 | nan |
ACAGACCACTCA | 82.0 | 3.943 | nan | 161.406 | nan | 51.700 | nan |
ACAGACCACTCA | 91.0 | 4.301 | nan | 239.934 | nan | 58.400 | nan |
ACAGACCACTCA | 100.0 | 4.471 | nan | 183.857 | nan | 61.100 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 10.0 | 1.878 | nan | 25.650 | nan | 8.300 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 19.0 | 2.697 | nan | 42.650 | nan | 14.900 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 28.0 | 3.218 | nan | 66.412 | nan | 19.300 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 37.0 | 3.854 | nan | 78.960 | nan | 25.400 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 46.0 | 4.092 | nan | 82.099 | nan | 28.800 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 55.0 | 4.539 | nan | 83.282 | nan | 32.100 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 64.0 | 4.715 | nan | 98.698 | nan | 35.100 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 73.0 | 5.187 | nan | 96.537 | nan | 40.700 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 82.0 | 5.338 | nan | 107.788 | nan | 42.900 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 91.0 | 5.643 | nan | 120.012 | nan | 48.000 | nan |
ACAGAGTCGGCT | 100.0 | 5.699 | nan | 109.366 | nan | 49.100 | nan |
ACCAGCGACTAG | 10.0 | 1.299 | nan | 32.000 | nan | 8.800 | nan |
ACCAGCGACTAG | 19.0 | 2.323 | nan | 68.900 | nan | 16.400 | nan |
ACCAGCGACTAG | 28.0 | 2.564 | nan | 75.958 | nan | 21.800 | nan |
ACCAGCGACTAG | 37.0 | 3.191 | nan | 87.155 | nan | 29.100 | nan |
ACCAGCGACTAG | 46.0 | 3.518 | nan | 143.428 | nan | 35.300 | nan |
ACCAGCGACTAG | 55.0 | 4.037 | nan | 151.184 | nan | 39.900 | nan |
ACCAGCGACTAG | 64.0 | 4.186 | nan | 154.661 | nan | 43.200 | nan |
ACCAGCGACTAG | 73.0 | 4.320 | nan | 135.267 | nan | 46.600 | nan |
ACCAGCGACTAG | 82.0 | 4.743 | nan | 238.448 | nan | 53.000 | nan |
ACCAGCGACTAG | 91.0 | 5.039 | nan | 200.001 | nan | 57.100 | nan |
ACCAGCGACTAG | 100.0 | 5.418 | nan | 209.870 | nan | 62.200 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 10.0 | 1.915 | nan | 45.400 | nan | 9.700 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 19.0 | 2.667 | nan | 106.600 | nan | 17.400 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 28.0 | 3.101 | nan | 80.500 | nan | 22.600 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 37.0 | 3.716 | nan | 105.833 | nan | 30.700 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 46.0 | 4.131 | nan | 182.311 | nan | 36.600 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 55.0 | 4.552 | nan | 170.839 | nan | 40.800 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 64.0 | 4.969 | nan | 166.744 | nan | 46.900 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 73.0 | 5.392 | nan | 175.437 | nan | 52.800 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 82.0 | 5.601 | nan | 191.788 | nan | 56.100 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 91.0 | 5.909 | nan | 235.229 | nan | 61.500 | nan |
ACCGCAGAGTCA | 100.0 | 6.219 | nan | 243.876 | nan | 66.700 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 10.0 | 1.968 | nan | 18.450 | nan | 7.900 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 19.0 | 2.340 | nan | 43.850 | nan | 12.600 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 28.0 | 2.977 | nan | 61.942 | nan | 17.700 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 37.0 | 3.264 | nan | 83.258 | nan | 21.800 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 46.0 | 3.665 | nan | 85.742 | nan | 25.100 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 55.0 | 4.098 | nan | 80.079 | nan | 30.000 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 64.0 | 4.293 | nan | 103.408 | nan | 33.000 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 73.0 | 4.389 | nan | 132.945 | nan | 36.400 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 82.0 | 5.018 | nan | 124.191 | nan | 42.300 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 91.0 | 4.962 | nan | 124.116 | nan | 42.800 | nan |
ACGGTGAGTGTC | 100.0 | 5.331 | nan | 168.212 | nan | 47.900 | nan |
AGCACGAGCCTA | 10.0 | 1.363 | nan | 28.250 | nan | 8.300 | nan |
AGCACGAGCCTA | 19.0 | 1.803 | nan | 31.533 | nan | 12.700 | nan |
AGCACGAGCCTA | 28.0 | 2.050 | nan | 58.408 | nan | 17.700 | nan |
AGCACGAGCCTA | 37.0 | 2.570 | nan | 92.600 | nan | 21.600 | nan |
AGCACGAGCCTA | 46.0 | 2.740 | nan | 104.708 | nan | 26.200 | nan |
AGCACGAGCCTA | 55.0 | 3.106 | nan | 174.483 | nan | 30.900 | nan |
AGCACGAGCCTA | 64.0 | 3.265 | nan | 175.815 | nan | 33.700 | nan |
AGCACGAGCCTA | 73.0 | 3.606 | nan | 140.712 | nan | 36.600 | nan |
AGCACGAGCCTA | 82.0 | 3.870 | nan | 111.559 | nan | 39.800 | nan |
AGCACGAGCCTA | 91.0 | 4.073 | nan | 184.542 | nan | 42.700 | nan |
AGCACGAGCCTA | 100.0 | 4.345 | nan | 155.064 | nan | 46.700 | nan |
AGCAGCACTTGT | 10.0 | 1.651 | nan | 20.900 | nan | 7.900 | nan |
AGCAGCACTTGT | 19.0 | 2.247 | nan | 38.933 | nan | 13.800 | nan |
AGCAGCACTTGT | 28.0 | 2.609 | nan | 44.317 | nan | 17.000 | nan |
AGCAGCACTTGT | 37.0 | 2.895 | nan | 48.384 | nan | 20.500 | nan |
AGCAGCACTTGT | 46.0 | 3.016 | nan | 50.042 | nan | 23.500 | nan |
AGCAGCACTTGT | 55.0 | 3.439 | nan | 67.744 | nan | 26.600 | nan |
AGCAGCACTTGT | 64.0 | 3.451 | nan | 62.245 | nan | 27.600 | nan |
AGCAGCACTTGT | 73.0 | 3.769 | nan | 65.043 | nan | 30.700 | nan |
AGCAGCACTTGT | 82.0 | 3.939 | nan | 66.905 | nan | 33.500 | nan |
AGCAGCACTTGT | 91.0 | 4.080 | nan | 70.952 | nan | 35.000 | nan |
AGCAGCACTTGT | 100.0 | 4.181 | nan | 79.656 | nan | 37.000 | nan |
SampleID | Seqs/Sample | PD_whole_tree Ave. | PD_whole_tree Err. | chao1 Ave. | chao1 Err. | observed_species Ave. | observed_species Err. |
PC.354 | 10.0 | 1.363 | nan | 28.250 | nan | 8.300 | nan |
PC.354 | 19.0 | 1.803 | nan | 31.533 | nan | 12.700 | nan |
PC.354 | 28.0 | 2.050 | nan | 58.408 | nan | 17.700 | nan |
PC.354 | 37.0 | 2.570 | nan | 92.600 | nan | 21.600 | nan |
PC.354 | 46.0 | 2.740 | nan | 104.708 | nan | 26.200 | nan |
PC.354 | 55.0 | 3.106 | nan | 174.483 | nan | 30.900 | nan |
PC.354 | 64.0 | 3.265 | nan | 175.815 | nan | 33.700 | nan |
PC.354 | 73.0 | 3.606 | nan | 140.712 | nan | 36.600 | nan |
PC.354 | 82.0 | 3.870 | nan | 111.559 | nan | 39.800 | nan |
PC.354 | 91.0 | 4.073 | nan | 184.542 | nan | 42.700 | nan |
PC.354 | 100.0 | 4.345 | nan | 155.064 | nan | 46.700 | nan |
PC.355 | 10.0 | 1.354 | nan | 23.200 | nan | 8.300 | nan |
PC.355 | 19.0 | 1.713 | nan | 51.050 | nan | 14.500 | nan |
PC.355 | 28.0 | 2.261 | nan | 60.057 | nan | 19.100 | nan |
PC.355 | 37.0 | 2.393 | nan | 81.785 | nan | 22.800 | nan |
PC.355 | 46.0 | 2.599 | nan | 120.280 | nan | 28.900 | nan |
PC.355 | 55.0 | 2.749 | nan | 127.919 | nan | 32.100 | nan |
PC.355 | 64.0 | 3.067 | nan | 100.930 | nan | 35.200 | nan |
PC.355 | 73.0 | 3.227 | nan | 111.347 | nan | 38.300 | nan |
PC.355 | 82.0 | 3.440 | nan | 89.824 | nan | 41.500 | nan |
PC.355 | 91.0 | 3.583 | nan | 100.172 | nan | 44.600 | nan |
PC.355 | 100.0 | 3.813 | nan | 125.530 | nan | 49.200 | nan |
PC.356 | 10.0 | 1.262 | nan | 25.800 | nan | 8.400 | nan |
PC.356 | 19.0 | 2.063 | nan | 85.750 | nan | 16.300 | nan |
PC.356 | 28.0 | 2.361 | nan | 106.783 | nan | 22.100 | nan |
PC.356 | 37.0 | 2.540 | nan | 95.093 | nan | 28.000 | nan |
PC.356 | 46.0 | 2.966 | nan | 176.074 | nan | 33.400 | nan |
PC.356 | 55.0 | 3.379 | nan | 145.933 | nan | 38.900 | nan |
PC.356 | 64.0 | 3.539 | nan | 157.168 | nan | 43.800 | nan |
PC.356 | 73.0 | 3.935 | nan | 159.373 | nan | 48.500 | nan |
PC.356 | 82.0 | 3.943 | nan | 161.406 | nan | 51.700 | nan |
PC.356 | 91.0 | 4.301 | nan | 239.934 | nan | 58.400 | nan |
PC.356 | 100.0 | 4.471 | nan | 183.857 | nan | 61.100 | nan |
PC.481 | 10.0 | 1.299 | nan | 32.000 | nan | 8.800 | nan |
PC.481 | 19.0 | 2.323 | nan | 68.900 | nan | 16.400 | nan |
PC.481 | 28.0 | 2.564 | nan | 75.958 | nan | 21.800 | nan |
PC.481 | 37.0 | 3.191 | nan | 87.155 | nan | 29.100 | nan |
PC.481 | 46.0 | 3.518 | nan | 143.428 | nan | 35.300 | nan |
PC.481 | 55.0 | 4.037 | nan | 151.184 | nan | 39.900 | nan |
PC.481 | 64.0 | 4.186 | nan | 154.661 | nan | 43.200 | nan |
PC.481 | 73.0 | 4.320 | nan | 135.267 | nan | 46.600 | nan |
PC.481 | 82.0 | 4.743 | nan | 238.448 | nan | 53.000 | nan |
PC.481 | 91.0 | 5.039 | nan | 200.001 | nan | 57.100 | nan |
PC.481 | 100.0 | 5.418 | nan | 209.870 | nan | 62.200 | nan |
PC.593 | 10.0 | 1.651 | nan | 20.900 | nan | 7.900 | nan |
PC.593 | 19.0 | 2.247 | nan | 38.933 | nan | 13.800 | nan |
PC.593 | 28.0 | 2.609 | nan | 44.317 | nan | 17.000 | nan |
PC.593 | 37.0 | 2.895 | nan | 48.384 | nan | 20.500 | nan |
PC.593 | 46.0 | 3.016 | nan | 50.042 | nan | 23.500 | nan |
PC.593 | 55.0 | 3.439 | nan | 67.744 | nan | 26.600 | nan |
PC.593 | 64.0 | 3.451 | nan | 62.245 | nan | 27.600 | nan |
PC.593 | 73.0 | 3.769 | nan | 65.043 | nan | 30.700 | nan |
PC.593 | 82.0 | 3.939 | nan | 66.905 | nan | 33.500 | nan |
PC.593 | 91.0 | 4.080 | nan | 70.952 | nan | 35.000 | nan |
PC.593 | 100.0 | 4.181 | nan | 79.656 | nan | 37.000 | nan |
PC.607 | 10.0 | 1.910 | nan | 29.833 | nan | 8.800 | nan |
PC.607 | 19.0 | 2.534 | nan | 38.960 | nan | 15.000 | nan |
PC.607 | 28.0 | 3.134 | nan | 66.758 | nan | 20.700 | nan |
PC.607 | 37.0 | 3.548 | nan | 73.808 | nan | 26.500 | nan |
PC.607 | 46.0 | 4.206 | nan | 101.362 | nan | 32.900 | nan |
PC.607 | 55.0 | 4.408 | nan | 130.980 | nan | 35.800 | nan |
PC.607 | 64.0 | 4.916 | nan | 154.486 | nan | 40.900 | nan |
PC.607 | 73.0 | 5.351 | nan | 147.368 | nan | 45.900 | nan |
PC.607 | 82.0 | 5.357 | nan | 181.234 | nan | 49.200 | nan |
PC.607 | 91.0 | 5.794 | nan | 166.101 | nan | 54.300 | nan |
PC.607 | 100.0 | 5.912 | nan | 210.383 | nan | 56.800 | nan |
PC.634 | 10.0 | 1.878 | nan | 25.650 | nan | 8.300 | nan |
PC.634 | 19.0 | 2.697 | nan | 42.650 | nan | 14.900 | nan |
PC.634 | 28.0 | 3.218 | nan | 66.412 | nan | 19.300 | nan |
PC.634 | 37.0 | 3.854 | nan | 78.960 | nan | 25.400 | nan |
PC.634 | 46.0 | 4.092 | nan | 82.099 | nan | 28.800 | nan |
PC.634 | 55.0 | 4.539 | nan | 83.282 | nan | 32.100 | nan |
PC.634 | 64.0 | 4.715 | nan | 98.698 | nan | 35.100 | nan |
PC.634 | 73.0 | 5.187 | nan | 96.537 | nan | 40.700 | nan |
PC.634 | 82.0 | 5.338 | nan | 107.788 | nan | 42.900 | nan |
PC.634 | 91.0 | 5.643 | nan | 120.012 | nan | 48.000 | nan |
PC.634 | 100.0 | 5.699 | nan | 109.366 | nan | 49.100 | nan |
PC.635 | 10.0 | 1.915 | nan | 45.400 | nan | 9.700 | nan |
PC.635 | 19.0 | 2.667 | nan | 106.600 | nan | 17.400 | nan |
PC.635 | 28.0 | 3.101 | nan | 80.500 | nan | 22.600 | nan |
PC.635 | 37.0 | 3.716 | nan | 105.833 | nan | 30.700 | nan |
PC.635 | 46.0 | 4.131 | nan | 182.311 | nan | 36.600 | nan |
PC.635 | 55.0 | 4.552 | nan | 170.839 | nan | 40.800 | nan |
PC.635 | 64.0 | 4.969 | nan | 166.744 | nan | 46.900 | nan |
PC.635 | 73.0 | 5.392 | nan | 175.437 | nan | 52.800 | nan |
PC.635 | 82.0 | 5.601 | nan | 191.788 | nan | 56.100 | nan |
PC.635 | 91.0 | 5.909 | nan | 235.229 | nan | 61.500 | nan |
PC.635 | 100.0 | 6.219 | nan | 243.876 | nan | 66.700 | nan |
PC.636 | 10.0 | 1.968 | nan | 18.450 | nan | 7.900 | nan |
PC.636 | 19.0 | 2.340 | nan | 43.850 | nan | 12.600 | nan |
PC.636 | 28.0 | 2.977 | nan | 61.942 | nan | 17.700 | nan |
PC.636 | 37.0 | 3.264 | nan | 83.258 | nan | 21.800 | nan |
PC.636 | 46.0 | 3.665 | nan | 85.742 | nan | 25.100 | nan |
PC.636 | 55.0 | 4.098 | nan | 80.079 | nan | 30.000 | nan |
PC.636 | 64.0 | 4.293 | nan | 103.408 | nan | 33.000 | nan |
PC.636 | 73.0 | 4.389 | nan | 132.945 | nan | 36.400 | nan |
PC.636 | 82.0 | 5.018 | nan | 124.191 | nan | 42.300 | nan |
PC.636 | 91.0 | 4.962 | nan | 124.116 | nan | 42.800 | nan |
PC.636 | 100.0 | 5.331 | nan | 168.212 | nan | 47.900 | nan |
LinkerPrimerSequence | Seqs/Sample | PD_whole_tree Ave. | PD_whole_tree Err. | chao1 Ave. | chao1 Err. | observed_species Ave. | observed_species Err. |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 10.0 | 1.622 | 0.285 | 27.720 | 7.427 | 8.489 | 0.524 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 19.0 | 2.265 | 0.331 | 56.470 | 23.899 | 14.844 | 1.561 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 28.0 | 2.697 | 0.402 | 69.015 | 16.570 | 19.778 | 1.981 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 37.0 | 3.108 | 0.508 | 82.986 | 15.194 | 25.156 | 3.454 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 46.0 | 3.437 | 0.591 | 116.227 | 41.544 | 30.078 | 4.409 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 55.0 | 3.812 | 0.625 | 125.827 | 37.636 | 34.122 | 4.664 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 64.0 | 4.045 | 0.693 | 130.462 | 37.291 | 37.711 | 5.920 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 73.0 | 4.353 | 0.754 | 129.336 | 31.734 | 41.833 | 6.655 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 82.0 | 4.583 | 0.750 | 141.460 | 52.143 | 45.556 | 6.914 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 91.0 | 4.820 | 0.802 | 160.118 | 56.455 | 49.378 | 8.377 |
YATGCTGCCTCCCGTAGGAGT | 100.0 | 5.043 | 0.807 | 165.090 | 50.217 | 52.967 | 8.843 |
Treatment | Seqs/Sample | PD_whole_tree Ave. | PD_whole_tree Err. | chao1 Ave. | chao1 Err. | observed_species Ave. | observed_species Err. |
Control | 10.0 | 1.386 | 0.138 | 26.030 | 3.872 | 8.340 | 0.287 |
Control | 19.0 | 2.030 | 0.239 | 55.233 | 19.814 | 14.740 | 1.435 |
Control | 28.0 | 2.369 | 0.204 | 69.105 | 21.342 | 19.540 | 2.083 |
Control | 37.0 | 2.718 | 0.288 | 81.004 | 16.944 | 24.400 | 3.483 |
Control | 46.0 | 2.968 | 0.314 | 118.907 | 41.989 | 29.460 | 4.384 |
Control | 55.0 | 3.342 | 0.425 | 133.453 | 36.061 | 33.680 | 5.026 |
Control | 64.0 | 3.502 | 0.379 | 130.164 | 42.145 | 36.700 | 6.111 |
Control | 73.0 | 3.771 | 0.361 | 122.348 | 32.496 | 40.140 | 6.583 |
Control | 82.0 | 3.987 | 0.421 | 133.628 | 61.019 | 43.900 | 7.408 |
Control | 91.0 | 4.215 | 0.474 | 159.120 | 63.399 | 47.560 | 8.929 |
Control | 100.0 | 4.446 | 0.534 | 150.796 | 45.388 | 51.240 | 9.433 |
Fast | 10.0 | 1.918 | 0.032 | 29.833 | 9.867 | 8.675 | 0.672 |
Fast | 19.0 | 2.560 | 0.141 | 58.015 | 28.108 | 14.975 | 1.698 |
Fast | 28.0 | 3.108 | 0.087 | 68.903 | 6.960 | 20.075 | 1.803 |
Fast | 37.0 | 3.596 | 0.220 | 85.465 | 12.226 | 26.100 | 3.174 |
Fast | 46.0 | 4.023 | 0.211 | 112.878 | 40.735 | 30.850 | 4.317 |
Fast | 55.0 | 4.399 | 0.183 | 116.295 | 37.390 | 34.675 | 4.101 |
Fast | 64.0 | 4.723 | 0.266 | 130.834 | 30.141 | 38.975 | 5.414 |
Fast | 73.0 | 5.080 | 0.406 | 138.072 | 28.434 | 43.950 | 6.117 |
Fast | 82.0 | 5.329 | 0.207 | 151.250 | 35.929 | 47.625 | 5.590 |
Fast | 91.0 | 5.577 | 0.367 | 161.364 | 46.303 | 51.650 | 6.994 |
Fast | 100.0 | 5.790 | 0.323 | 182.959 | 50.241 | 55.125 | 7.505 |