filter_by_volume — 3D regionprops op

• Datenarten: voxel → voxel

• Aufruf: import fullseye as fs; fs.ledger.filter_by_volume(vol, min_voxels: 'int', connectivity: 'int' = 26) -> 'np.ndarray' (die Implementierung direkt: import regionprops3d; regionprops3d.filter_by_volume(vol, min_voxels: 'int', connectivity: 'int' = 26) -> 'np.ndarray'; aus dem Register: ops3d.get("filter_by_volume"))

Verwendung

Liefert eine bool-Maske, aus der die Komponenten unter min_voxels entfernt sind.

Parameters

vol : array_like

3D-Array aus bool oder 0/1.

min_voxels : int

Verwirft Komponenten "unter" diesem Schwellwert (< min_voxels). Komponenten "ab" dem Schwellwert bleiben.

connectivity : int

6 / 18 / 26.

Returns

ndarray(bool)

Nur für Komponenten, die die Bedingung erfüllen, True. Ohne Vordergrund oder wenn alle Komponenten entfernt werden, lauter False.

Ergänzung:

• min_voxels wird vor dem Vergleich mit int() gerundet. Bei 1 oder weniger bleiben alle Komponenten erhalten.

• Intern label_components → bincount → Labels mit counts >= min_voxels behalten. Labels werden nicht neu nummeriert, und es wird nur eine bool-Maske zurückgegeben; werden Nummern gebraucht, das Ergebnis noch einmal durch label_components schicken.

• Die Eingabe wird mit allem außer 0 als Vordergrund in bool umgewandelt (auch NaN ist Vordergrund). Achsenreihenfolge (z, y, x).

• Raises ValueError: Eingabe nicht 3-dimensional, connectivity ungleich 6/18/26.

• Voxelanzahlen sind nicht abstandskorrigiert; für einen Schwellwert in physischen Maßen vorher durch das voxel-Volumen teilen und dann übergeben.

Hintergrundwissen (Physik und Konventionen hinter diesem Operator)

• measurement_uncertainty — Messunsicherheit und Kalibrierung — was nötig ist, um zu behaupten, dass man misst

Referenzen (Beispieldaten, Literatur)

• Katalog der Beispieldaten (Download-URLs / Lizenzen) — 2-D nutzt skimage.data (BSD/Public Domain) plus synthetische Bilder, 3-D nennt Download-URLs echter Datenquellen (Stanford, PDS, …).

• Herkunft und Literatur der Operatoren — die Quellen der Forschung/Verfahren, auf denen diese Operatorfamilie beruht.

Ausführbare Beispiele (verifizierte Samples, die diesen Operator wirklich aufrufen)

• region_props_3d — py -3.11 examples_3d/region_props_3d.py

Typkompatible Folge-Operatoren (nehmen voxel als Eingabe)

voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa

Gleiche Kategorie (regionprops)

label_components · region_props · largest_component · inner_box3 · vol_label · vol_region_props


*Provenance: regionprops3d.py — 3D Operator-Registry. Diese Notiz wird von tools/opdocs.py md erzeugt (nicht von Hand bearbeiten).*

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