points_activity_video — CONNGRAPH `activity` op

• 数据种类:points × matrix → rgbvideo

• 调用: import fullseye as fs; fs.ledger.points_activity_video(P: 'Any', X: 'Any', colors: 'Any' = None, size: 'int' = 480, aspect: 'float' = 0.75, pitch: 'float' = 15.0, yaw_start: 'float' = 0.0, yaw_span: 'float' = 360.0, substeps: 'int' = 1, point_px: 'int' = 2, gain: 'float' = 100.0, background: 'Any' = None, views: 'Any' = None) -> 'np.ndarray'(要直接调用实现,import conngraph; conngraph.points_activity_video(P: 'Any', X: 'Any', colors: 'Any' = None, size: 'int' = 480, aspect: 'float' = 0.75, pitch: 'float' = 15.0, yaw_start: 'float' = 0.0, yaw_span: 'float' = 360.0, substeps: 'int' = 1, point_px: 'int' = 2, gain: 'float' = 100.0, background: 'Any' = None, views: 'Any' = None) -> 'np.ndarray';从台账取用则 opsconngraph.get("points_activity_video"))

用法

将活动叠加到点云上并旋转的彩色视频 (F, H, W, 3)，值 [0, 1]。F = T × substeps、H = size、W = size × aspect。

在 views 中传入 (yaw, pitch) 序列(度)时,不旋转,而是把从这些方向看到的帧横向排列(W = views 数 × size × aspect + 4 px 的间隙,不使用 yaw_start / yaw_span)。用于从多个方向比较同一瞬间(例:背侧 (0, 0) / 侧面 (90, 0) / 体轴方向 (0, 90))。

P = (n, 3) 的坐标,X = (T, n) 的状态序列(reservoir_states)。第 k 帧把时刻 k / substeps 的状态(相邻步之间的线性插值)用 yaw = yaw_start + yaw_span × k / F 的相机做正射投影。亮度 b = log1p(gain · |x| / max|X|) / log1p(gain) —— 所有帧共用 1 个尺度(按帧拉伸的话, 不动的东西会闪烁)。节点颜色 = colors((n, 3),[0, 1],None 则为白色)× (0.2 + 0.8 b), b > 0.5 的节点画得大一圈、更亮。background 先以浅灰铺上 (m, 3) 的点云(例如把选中的节点叠在大脑全部 soma 之上)。视场角由 P 与 background 合起来的盒子决定。输出限制为 F×H×W×3 ≤ MAX_VIDEO_ELEMENTS(2^27)。

详细使用指南

• conngraph 族使用指南

参考(示例数据、文献)

• 示例数据目录(下载 URL / 许可证) —— 2-D 用 skimage.data(BSD/公有领域)加合成图,3-D 给出真实数据源(Stanford/PDS 等)的下载 URL。

• 算子来历与参考文献 —— 该算子族所依据的研究/方法出处。

• 算法的正典(作者、年份)与用途见上面的族使用指南。

可运行的示例(实际调用该算子并已验证的样例)

• poc_connectome_motor_bottleneck — py -3.11 examples/poc_connectome_motor_bottleneck.py

• poc_em_branch_territory — py -3.11 examples/poc_em_branch_territory.py

• poc_em_second_opinion — py -3.11 examples/poc_em_second_opinion.py

• poc_eye_to_brain — py -3.11 examples/poc_eye_to_brain.py

• poc_malecns_activity_wave — py -3.11 examples/poc_malecns_activity_wave.py

• poc_microns_brain_wave — py -3.11 examples/poc_microns_brain_wave.py

类型可衔接的下一个算子(可接受 `rgbvideo` 作为输入)

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同类别(`activity`)

graph_activation_latency · graph_activity_spread

*Provenance: conngraph.py — CONNGRAPH 算子登记表。本条目由 tools/opdocs.py md 自动生成(请勿手工编辑)。*

points_activity_video — CONNGRAPH activity op

用法