tree op• Data kinds: text → table
• Call: import fullseye as fs; fs.ledger.tree_from_swc(swc) (implementation को सीधे call करना हो तो import treemorph; treemorph.tree_from_swc(swc), registry से लेना हो तो opsgraph.get("tree_from_swc"))
SWC text (या .swc file का path) को parse करके जाँची गई tree table बनाता है।
> नीचे का विस्तृत विवरण मूल text में है — सारांश और headings का अनुवाद हो चुका है।
Returns a dict with id (n,), type (n,), xyz (n, 3), radius (n,), parent_index (n,; -1 for the root, otherwise the row of the parent) and root (row of the root). Rows keep the file order. Comment lines (#) and blank lines are skipped.
Raises ValueError: not a string; a data line with fewer than 7 fields or unparsable numbers; no nodes; duplicate ids; zero or more than one root (parent == -1); a parent id that is not smaller than its child's; a parent id that does not exist; non-finite coordinates or radius; a negative radius; more than MAX_TREE_NODES nodes.
• Sample data catalog (DL URL / license) — 2-D के लिए skimage.data (BSD/public) + synthetic, 3-D के लिए real data sources (Stanford/PDS आदि) के DL URL।
• Operators का स्रोत और संदर्भ — इस op family के मूल research/methods के स्रोत।
• Algorithm का मानक स्रोत (लेखक, वर्ष) और उपयोग ऊपर की family usage guide में दिए गए हैं।
• poc_skeleton_run_length_vs_voi — py -3.11 examples/poc_skeleton_run_length_vs_voi.py
• poc_swc_tree_truth — py -3.11 examples/poc_swc_tree_truth.py
• poc_worm_neurites_grow — py -3.11 examples/poc_worm_neurites_grow.py
• poc_worm_synapses_vs_neurites — py -3.11 examples/poc_worm_synapses_vs_neurites.py
table को input के रूप में लेते हैं)graph_edge_consensus · graph_core_persistence · tree_morphometry · tree_sholl · tree_run_length
tree)tree_morphometry · tree_sholl · tree_run_length
*Provenance: treemorph.py — GRAPH operator registry. यह per-op note tools/opdocs.py md से अपने-आप generate होता है (हाथ से edit न करें)।*
© 2026 Kazufumi Furuse — Fullseye operator documentation. Licensed under Apache-2.0.