seg_membrane_chord_score — EMPROOF `suspect` op

• 데이터 종류: labels2d × image2d → table

• 호출: import fullseye as fs; fs.ledger.seg_membrane_chord_score(labels, membrane, tau: 'float' = 0.2, band: 'int' = 4, min_area: 'int' = 1500, min_segment: 'int' = 20, normalize: 'bool' = True, ignore_zero: 'bool' = True, max_points: 'int' = 400, min_hole: 'int' = 4) -> 'dict'(구현을 직접 호출하려면 import emproof; emproof.seg_membrane_chord_score(labels, membrane, tau: 'float' = 0.2, band: 'int' = 4, min_area: 'int' = 1500, min_segment: 'int' = 20, normalize: 'bool' = True, ignore_zero: 'bool' = True, max_points: 'int' = 400, min_hole: 'int' = 4) -> 'dict', 원장에서 가져오려면 opsemproof.get("seg_membrane_chord_score"))

• GPU: 없음(CPU 참조 구현만)

사용법

융합 의심: 라벨 내부를 가로지르는 막의 '현' 길이 / 라벨의 지름. 라벨(연결 성분)마다 1행.

절차 : 성분의 내부 (경계에서 "band"px보다 내)에서 막 응답> "tau"의 픽셀을 8 개의 연결 성분으로 만들고,

min_segment ''px 이상의 막 성분마다 3px 뚱뚱하게 경계 측 ( "거리 ≤ band + 3") 만지는 픽셀의 **최원 2점간 거리**를 현장으로 한다. score = max 현장 / sqrt(면적). 경계의 두 곳을 연결하는 멤브레인(= 붙은 2 세포 경계)는 score ≈ 1, 경계를 만지지 않는 단편은 0 작다. **구멍이 있는 멤브레인 성분** (min_hole ''px 이상의 구멍 = 닫힌 바퀴 = 미토콘드리아 · 소포)는 현의 후보에서 제거한다 - 경계의 두 점에접하는 고리는 현과 같은 「먼 2 점」을 가지므로, 구멍의 유무로 먼저 나눈다. 고리가 끊어져 호가 된 막은제거할 수 없다(실제 데이터에서 AUC가 1이 되지 않는 주인).

CREMI 샘플 A(512² 단면 12장, 프로토타입)에서 인공 융합 성분 vs 등: AUC 0.83(tau 0.2).

열 :label ''/component ''/area ''/score ''/chord_px ''/n_segments ''/cy''/cx '' (score 내림차순). min_area 미만의 성분은 세지 않는다 (작은 단편의 현은 지름과 같은 정도로 항상 높게 나온다).

>>> table = seg_membrane_chord_score(labels, seg_membrane_response(raw))

>>> table["label"][:5], table["score"][:5] # 의심스러운 순서

자세한 사용 가이드

• emproof 패밀리 가이드

참고(샘플 데이터·문헌)

• 샘플 데이터 카탈로그(DL URL / 라이선스) —— 2-D 는 skimage.data(BSD/public)+ 합성, 3-D 는 실데이터 소스(Stanford/PDS 등)의 DL URL.

• 연산자의 내력·참고문헌 —— 이 연산자 족의 바탕이 된 연구/기법의 출처.

• 알고리즘의 정전(저자·연도)과 용도는 위의 패밀리 사용 가이드에 적혀 있습니다.

실행 가능한 예제(이 연산자를 실제로 호출하는 검증된 샘플)

• poc_em_second_opinion — py -3.11 examples/poc_em_second_opinion.py

타입이 이어지는 다음 연산자(`table` 를 입력으로 받는 것)

seg_synapse_partners · seg_wiring_variation · seg_synapse_nri · seg_wiring_exposure

같은 카테고리(`suspect`)

seg_boundary_membrane_gap

*Provenance: emproof.py — EMPROOF 연산자 레지스트리. 이 op 노트는 tools/opdocs.py md 가 자동 생성합니다(직접 편집하지 마세요).*

seg_membrane_chord_score — EMPROOF suspect op

사용법