cif_read — DRIVE `pxrd` op

• Datenarten: any → table

• Aufruf: import fullseye as fs; fs.ledger.cif_read(cif, name=None, default_b=0.5) (die Implementierung direkt: import pxrd; pxrd.cif_read(cif, name=None, default_b=0.5); aus dem Register: opsdrive.get("cif_read"))

Verwendung

Liest eine CIF-Datei (Standardformat für Kristallstrukturen) und gibt eine auf alle Atome der Elementarzelle expandierte "Phase" zurück.

cif ist ein Dateipfad oder der CIF-Text (String; enthält er data_ oder _cell_length_a, gilt er als Text). Gelesen werden: _cell_length_a/b/c, _cell_angle_alpha/beta/gamma, die Schleife der Symmetrieoperationen (_space_group_symop_operation_xyz oder _symmetry_equiv_pos_as_xyz, sonst nur die Identität), die Atomschleife (_atom_site_fract_x/y/z, _atom_site_type_symbol (sonst das Elementsymbol am Anfang des Labels), _atom_site_occupancy (Standard 1), _atom_site_U_iso_or_equiv oder _atom_site_B_iso_or_equiv (sonst default_b [Å²])). Die Klammern der Messunsicherheit (4.76050(5)) werden entfernt. Die Symmetrieoperationen werden mit einem eigenen kleinen Parser gelesen, ohne eval.

Rückgabe (dict, Phase): name, cell (a, b, c [Å], α, β, γ [deg]), volume [Å³], atoms (list der expandierten Atome:

type, xyz, occ, B), cell_mass [g/mol], density [g/cm³], notes (z. B. Ionen, die durch neutrale Atome ersetzt wurden), source (DOI und COD-Nummer, falls vorhanden). Eingabe für powder_reflections und phase_dictionary.

Raises ValueError: Gitterkonstanten fehlen oder sind nicht numerisch, Symmetrieoperationen nicht lesbar, keine Atome, Element ohne Streufaktor.

Referenzen (Beispieldaten, Literatur)

• Katalog der Beispieldaten (Download-URLs / Lizenzen) — 2-D nutzt skimage.data (BSD/Public Domain) plus synthetische Bilder, 3-D nennt Download-URLs echter Datenquellen (Stanford, PDS, …).

• Herkunft und Literatur der Operatoren — die Quellen der Forschung/Verfahren, auf denen diese Operatorfamilie beruht.

• Der kanonische Algorithmus (Autor, Jahr) und seine Anwendungen stehen im Familienleitfaden oben.

Ausführbare Beispiele (verifizierte Samples, die diesen Operator wirklich aufrufen)

• poc_pxrd_phase_peel — py -3.11 examples/poc_pxrd_phase_peel.py

Typkompatible Folge-Operatoren (nehmen `table` als Eingabe)

course_layout · course_occupancy · course_contains · world_build · world_camera · world_move · lidar_scan · rss_longitudinal_same

Gleiche Kategorie (`pxrd`)

cubic_prototype · powder_reflections · scherrer_size · debye_ring_image · detector_two_theta · detector_calibrate · azimuthal_integrate · diffraction_peaks

*Provenance: pxrd.py — DRIVE Operator-Registry. Diese Notiz wird von tools/opdocs.py md erzeugt (nicht von Hand bearbeiten).*

cif_read — DRIVE pxrd op