Protein IDs	Majority protein IDs	Peptide counts (all)	Peptide counts (razor+unique)	Peptide counts (unique)	Fasta headers	Number of proteins	Peptides	Razor + unique peptides	Unique peptides	Peptides SampleA_1	Peptides SampleB_1	Razor + unique peptides SampleA_1	Razor + unique peptides SampleB_1	Unique peptides SampleA_1	Unique peptides SampleB_1	Sequence coverage [%]	Unique + razor sequence coverage [%]	Unique sequence coverage [%]	Mol. weight [kDa]	Sequence length	Sequence lengths	Q-value	Score	Sequence coverage SampleA_1 [%]	Sequence coverage SampleB_1 [%]	Intensity	Intensity SampleA_1	Intensity SampleB_1	iBAQ peptides	iBAQ	iBAQ SampleA_1	iBAQ SampleB_1	LFQ intensity SampleA_1	LFQ intensity SampleB_1	MS/MS count SampleA_1	MS/MS count SampleB_1	MS/MS count	Peptide sequences	Only identified by site	Reverse	Potential contaminant	id	Peptide IDs	Peptide is razor	Mod. peptide IDs	Evidence IDs	MS/MS IDs	Best MS/MS	Oxidation (M) site IDs	Oxidation (M) site positions	Taxonomy IDs
CON__Q3MHN5;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000018229	CON__Q3MHN5;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000018229	1;1	1;1	1;1	;	2	1	1	1	0	1	0	1	0	1	1.5	1.5	1.5	53.341	474	474;475	0	8.2389	0	1.5	11734000	0	11734000	25	469370	0	469370	0	0	0	1	1	ILESTLK			+	0	440	True	440	585	590	590			-1;-1
CON__P05784;CON__H-INV:HIT000015463;sp|P19012|K1C15_HUMAN;sp|P35527|K1C9_HUMAN;CON__P13645;sp|P13645|K1C10_HUMAN;CON__Q99456;sp|Q99456|K1C12_HUMAN;CON__P08779;sp|P08779|K1C16_HUMAN;CON__P02533;sp|P02533|K1C14_HUMAN;CON__P19012;CON__P08727;CON__A2A4G1;CON__P08730-1;CON__Q9QWL7;CON__Q04695;sp|Q04695|K1C17_HUMAN;sp|P05783|K1C18_HUMAN;CON__P19001;sp|P08727|K1C19_HUMAN;CON__P35527	CON__P05784;CON__H-INV:HIT000015463;sp|P19012|K1C15_HUMAN;sp|P35527|K1C9_HUMAN;CON__P13645;sp|P13645|K1C10_HUMAN;CON__Q99456;sp|Q99456|K1C12_HUMAN;CON__P08779;sp|P08779|K1C16_HUMAN;CON__P02533;sp|P02533|K1C14_HUMAN;CON__P19012;CON__P08727;CON__A2A4G1;CON__P08730-1;CON__Q9QWL7;CON__Q04695;sp|Q04695|K1C17_HUMAN;sp|P05783|K1C18_HUMAN;CON__P19001;sp|P08727|K1C19_HUMAN;CON__P35527	2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1	2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1	2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1	;;sp|P19012|K1C15_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 15 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT15 PE=1 SV=3;sp|P35527|K1C9_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=KRT9 PE=1 SV=3;;sp|P13645|K1C10_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 10 OS=Homo 	23	2	2	2	0	2	0	2	0	2	3.3	3.3	3.3	47.538	423	423;295;456;623;593;584;494;494;473;473;472;472;456;400;456;437;433;432;432;430;403;400;623	0	14.352	0	3.3	7579700	0	7579700	26	291530	0	291530	0	0	0	2	2	LASYLDK;NREELDK			+	4	497;729	True;True	498;731	661;963	666;979	666;979			-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1
CON__Q2UVX4	CON__Q2UVX4	1	1	1		1	1	1	1	1	0	1	0	1	0	0.6	0.6	0.6	187.37	1662	1662	0	7.2675	0.6	0	1419200	1419200	0	99	14335	14335	0	0	0	1	0	1	AGDFLENHYR			+	10	29	True	29	40	40	40			-1
REV__sp|Q14257|RCN2_HUMAN	REV__sp|Q14257|RCN2_HUMAN	1	1	1	sp|Q14257|RCN2_HUMAN Reticulocalbin-2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RCN2 PE=1 SV=1	1	1	1	1	0	1	0	1	0	1	0	0	0	36.876	317	317	0.0017301	5.8965	0	0	4362600	0	4362600	0	NaN	NaN	NaN	0	0	0	1	1	LQQEEHGK		+		13	583	True	584	772	780	780			-1
sp|O60763|USO1_HUMAN;REV__sp|Q5VZ89|DEN4C_HUMAN	sp|O60763|USO1_HUMAN;REV__sp|Q5VZ89|DEN4C_HUMAN	1;1	1;1	1;1	sp|O60763|USO1_HUMAN General vesicular transport factor p115 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=USO1 PE=1 SV=2;sp|Q5VZ89|DEN4C_HUMAN DENN domain-containing protein 4C OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DENND4C PE=1 SV=3	2	1	1	1	0	1	0	1	0	1	0.7	0.7	0.7	107.89	962	962;1909	0	10.398	0	0.7	1753500	0	1753500	43	40780	0	40780	0	0	0	1	1	LLTSLLK				14	556	True	557	739	746	746			-1;-1
sp|O95831|AIFM1_HUMAN	sp|O95831|AIFM1_HUMAN	1	1	1	sp|O95831|AIFM1_HUMAN Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=AIFM1 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1.1	1.1	1.1	66.9	613	613	0	6.4721	1.1	1.1	2259200	897390	1361800	31	72876	28948	43928	0	0	1	1	2	SLSAIDR				94	867	True	869	1149;1150	1172;1173	1172			-1
sp|P00505|AATM_HUMAN	sp|P00505|AATM_HUMAN	2	2	2	sp|P00505|AATM_HUMAN Aspartate aminotransferase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GOT2 PE=1 SV=3	1	2	2	2	1	1	1	1	1	1	4	4	4	47.517	430	430	0	12.9	1.9	2.1	2679800	833210	1846600	26	103070	32047	71025	0	0	1	1	2	MNLGVGAYR;PYVLPSVR				99	668;770	True;True	669;772	883;1019	895;1035	895;1035	17	60	-1
sp|P06733|ENOA_HUMAN	sp|P06733|ENOA_HUMAN	4	4	4	sp|P06733|ENOA_HUMAN Alpha-enolase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ENO1 PE=1 SV=2	1	4	4	4	3	4	3	4	3	4	9	9	9	47.168	434	434	0	49.786	7.4	9	918560000	357150000	561410000	22	40074000	16019000	24055000	296510000	274580000	5	6	11	EGLELLK;IEEELGSK;TIAPALVSK;VNQIGSVTESLQACK				124	202;413;924;1057	True;True;True;True	202;413;926;1059	266;553;554;1226;1227;1414;1415	268;556;557;558;559;1250;1251;1252;1253;1254;1443;1444	268;556;1250;1443			-1
sp|P09651|ROA1_HUMAN;sp|A0A2R8Y4L2|RA1L3_HUMAN;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN	sp|P09651|ROA1_HUMAN;sp|A0A2R8Y4L2|RA1L3_HUMAN;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN	4;3;3	4;3;3	3;2;2	sp|P09651|ROA1_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1 PE=1 SV=5;sp|A0A2R8Y4L2|RA1L3_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPA1L3 PE=4 SV=1;sp|Q32P51|RA1L2_HUMAN He	3	4	4	3	2	4	2	4	2	3	13.2	13.2	10.8	38.746	372	372;275;320	0	53.135	6.7	13.2	412230000	134220000	278010000	18	22902000	7456700	15445000	166060000	157520000	2	4	6	EDSQRPGAHLTVK;EDTEEHHLR;GFAFVTFDDHDSVDK;YHTVNGHNCEVR				145	176;178;338;1129	True;True;True;True	176;178;338;1131	232;233;236;452;1505;1506	234;235;238;455;1536;1537	234;238;455;1536			-1;-1;-1
sp|P22314|UBA1_HUMAN	sp|P22314|UBA1_HUMAN	2	2	2	sp|P22314|UBA1_HUMAN Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=UBA1 PE=1 SV=3	1	2	2	2	1	2	1	2	1	2	1.6	1.6	1.6	117.85	1058	1058	0	17.423	0.9	1.6	9630300	1954200	7676100	54	178340	36189	142150	0	0	1	2	3	NIILGGVK;SDTAAAAVR				207	707;842	True;True	709;844	933;1117;1118	946;1138;1139	946;1138			-1
sp|P30050|RL12_HUMAN	sp|P30050|RL12_HUMAN	1	1	1	sp|P30050|RL12_HUMAN 60S ribosomal protein L12 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RPL12 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	9.7	9.7	9.7	17.818	165	165	0	7.4408	9.7	9.7	29498000	9148000	20350000	9	3277600	1016400	2261200	0	0	1	1	2	EILGTAQSVGCNVDGR				242	223	True	223	296;297	298;299	299			-1
sp|P52597|HNRPF_HUMAN;sp|P55795|HNRH2_HUMAN;sp|P31943|HNRH1_HUMAN	sp|P52597|HNRPF_HUMAN;sp|P55795|HNRH2_HUMAN;sp|P31943|HNRH1_HUMAN	1;1;1	1;1;1	1;1;1	sp|P52597|HNRPF_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPF PE=1 SV=3;sp|P55795|HNRH2_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HNRNPH2 PE=1 SV=1;sp|P31943|HNRH1_HUMAN Heterogeneous nu	3	1	1	1	1	0	1	0	1	0	2.4	2.4	2.4	45.671	415	415;449;449	0	23.634	2.4	0	11860000	11860000	0	15	790660	790660	0	0	0	1	0	1	VHIEIGPDGR				253	1025	True	1027	1372	1401	1401			-1;-1;-1
sp|P63261|ACTG_HUMAN;sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63267|ACTH_HUMAN;sp|P68133|ACTS_HUMAN;sp|P68032|ACTC_HUMAN;sp|P62736|ACTA_HUMAN;sp|Q562R1|ACTBL_HUMAN;sp|Q6S8J3|POTEE_HUMAN;sp|P0CG38|POTEI_HUMAN;sp|A5A3E0|POTEF_HUMAN	sp|P63261|ACTG_HUMAN;sp|P60709|ACTB_HUMAN;sp|P63267|ACTH_HUMAN;sp|P68133|ACTS_HUMAN;sp|P68032|ACTC_HUMAN;sp|P62736|ACTA_HUMAN;sp|Q562R1|ACTBL_HUMAN;sp|Q6S8J3|POTEE_HUMAN;sp|P0CG38|POTEI_HUMAN;sp|A5A3E0|POTEF_HUMAN	2;2;2;2;2;2;1;1;1;1	2;2;2;2;2;2;1;1;1;1	2;2;2;2;2;2;1;1;1;1	sp|P63261|ACTG_HUMAN Actin, cytoplasmic 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTG1 PE=1 SV=1;sp|P60709|ACTB_HUMAN Actin, cytoplasmic 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTB PE=1 SV=1;sp|P63267|ACTH_HUMAN Actin, gamma-enteric smooth muscle OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACTG	10	2	2	2	2	1	2	1	2	1	5.3	5.3	5.3	41.792	375	375;375;376;377;377;377;376;1075;1075;1075	0	29.904	5.3	2.4	459410000	168420000	291000000	20	22971000	8420800	14550000	0	0	2	2	4	AVFPSIVGR;HQGVMVGMGQK				365	78;388	True;True	78;388	107;108;519	107;108;109;522	107;522	93;94	44;47	-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1;-1
sp|P60842|IF4A1_HUMAN;sp|Q14240|IF4A2_HUMAN	sp|P60842|IF4A1_HUMAN;sp|Q14240|IF4A2_HUMAN	3;2	3;2	2;1	sp|P60842|IF4A1_HUMAN Eukaryotic initiation factor 4A-I OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4A1 PE=1 SV=1;sp|Q14240|IF4A2_HUMAN Eukaryotic initiation factor 4A-II OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EIF4A2 PE=1 SV=2	2	3	3	2	0	3	0	3	0	2	9.4	9.4	5.4	46.153	406	406;407	0	32.944	0	9.4	13941000	0	13941000	23	606140	0	606140	0	0	0	3	3	FMRDPIR;GIYAYGFEKPSAIQQR;LQMEAPHIIVGTPGR				366	307;351;581	True;True;True	307;351;582	411;469;770	414;472;778	414;472;778	95;96	149;228	-1;-1
sp|Q06210|GFPT1_HUMAN	sp|Q06210|GFPT1_HUMAN	3	3	3	sp|Q06210|GFPT1_HUMAN Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GFPT1 PE=1 SV=3	1	3	3	3	2	1	2	1	2	1	3.1	3.1	3.1	78.806	699	699	0	19.366	2	1.1	4240500	1700100	2540400	43	98617	39538	59079	0	0	2	1	3	EILETLIK;EIMLGLK;PVVICDK				434	222;225;769	True;True;True	222;225;771	295;299;1018	297;301;1034	297;301;1034	117	525	-1
sp|Q07955|SRSF1_HUMAN	sp|Q07955|SRSF1_HUMAN	2	2	2	sp|Q07955|SRSF1_HUMAN Serine/arginine-rich splicing factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRSF1 PE=1 SV=2	1	2	2	2	2	1	2	1	2	1	6.9	6.9	6.9	27.744	248	248	0	34.877	6.9	3.6	27291000	13245000	14046000	13	2099300	1018800	1080500	0	0	2	1	3	DAEDAVYGR;EDMTYAVR				437	96;174	True;True	96;174	133;134;230	134;135;232	134;232	118	168	-1
sp|Q13242|SRSF9_HUMAN	sp|Q13242|SRSF9_HUMAN	1	1	1	sp|Q13242|SRSF9_HUMAN Serine/arginine-rich splicing factor 9 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRSF9 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	4.1	4.1	4.1	25.542	221	221	0	8.2287	4.1	4.1	7130800	2715900	4414900	15	475390	181060	294330	0	0	1	1	2	DAEDAIYGR				456	94	True	94	130;131	131;132	131			-1
sp|Q99798|ACON_HUMAN	sp|Q99798|ACON_HUMAN	2	2	2	sp|Q99798|ACON_HUMAN Aconitate hydratase, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ACO2 PE=1 SV=2	1	2	2	2	0	2	0	2	0	2	3.1	3.1	3.1	85.424	780	780	0	24.532	0	3.1	9073100	0	9073100	38	46999	0	46999	0	0	0	2	2	EHAALEPR;IVYGHLDDPASQEIER				583	206;477	True;True	206;478	271;637	273;642	273;642			-1
sp|Q99848|EBP2_HUMAN	sp|Q99848|EBP2_HUMAN	1	1	1	sp|Q99848|EBP2_HUMAN Probable rRNA-processing protein EBP2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EBNA1BP2 PE=1 SV=2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	2.6	2.6	2.6	34.852	306	306	0	11.039	2.6	2.6	10509000	3939300	6569800	15	700610	262620	437990	0	0	1	1	2	VQTEVLQK				585	1069	True	1071	1430;1431	1460;1461	1461			-1
sp|Q9H993|ARMT1_HUMAN	sp|Q9H993|ARMT1_HUMAN	1	1	1	sp|Q9H993|ARMT1_HUMAN Damage-control phosphatase ARMT1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ARMT1 PE=1 SV=1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	1	2.3	2.3	2.3	51.172	441	441	0	7.023	2.3	2.3	1461300	566850	894480	21	69587	26993	42594	0	0	1	1	2	HGEEGVEAEK				607	371	True	371	498;499	501;502	501			-1
