seg_membrane_response — EMPROOF response op

• Datenarten: image2d → image2d

• Aufruf: import fullseye as fs; fs.ledger.seg_membrane_response(image, sigma: 'float' = 1.5, normalize: 'bool' = True) -> 'np.ndarray' (die Implementierung direkt: import emproof; emproof.seg_membrane_response(image, sigma: 'float' = 1.5, normalize: 'bool' = True) -> 'np.ndarray'; aus dem Register: opsemproof.get("seg_membrane_response"))

Verwendung

> Für diesen Operator gibt es noch keine Übersetzung. Es folgt der Originaltext unverändert.

EM 断面の暗い線(細胞膜)の応答 [0, ∞)。ガウス平滑した Hessian の固有値 λ1 ≥ λ2 から

`max(λ1 − |λ2|, 0)` (Steger の線検出の閉形式、σ² で尺度正規化)。

暗い線の上では横断方向の 2 階微分が大きく正(λ1)、線に沿う方向は 0(λ2)なので λ1 − |λ2| が立つ。

暗い塊(ミトコンドリア内部・シナプス小胞)は λ1 ≈ λ2 > 0 で打ち消し合って 0 に近い ―― 膜だけを

拾う。`normalize=True で断面の 99.5 percentile を 1 にする(seg_*` の閾値はその尺度で書く)。

scikit-image があるならレジストリの `sk_frangi(fs.apply(img, "sk_frangi", a=0.5, b=0.5)`)も

同じ席に使える(試作はそちらで AUC を測った)。

Parameters

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image : (H, W) float

生 EM(明るい = 細胞質、暗い = 膜)。範囲は問わない(勾配の比だけを見る)。

sigma : float

平滑の σ [px]。膜の太さの半分程度(CREMI 4 nm/px なら 1.5〜2.5)。

Ausführlicher Anwendungsleitfaden

• Leitfaden zur Familie emproof

Referenzen (Beispieldaten, Literatur)

• Katalog der Beispieldaten (Download-URLs / Lizenzen) — 2-D nutzt skimage.data (BSD/Public Domain) plus synthetische Bilder, 3-D nennt Download-URLs echter Datenquellen (Stanford, PDS, …).

• Herkunft und Literatur der Operatoren — die Quellen der Forschung/Verfahren, auf denen diese Operatorfamilie beruht.

• Der kanonische Algorithmus (Autor, Jahr) und seine Anwendungen stehen im Familienleitfaden oben.

Ausführbare Beispiele (verifizierte Samples, die diesen Operator wirklich aufrufen)

• poc_em_second_opinion — py -3.11 examples/poc_em_second_opinion.py

Typkompatible Folge-Operatoren (nehmen image2d als Eingabe)

seg_membrane_chord_score · seg_boundary_membrane_gap

Gleiche Kategorie (response)

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*Provenance: emproof.py — EMPROOF Operator-Registry. Diese Notiz wird von tools/opdocs.py md erzeugt (nicht von Hand bearbeiten).*

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