seg_membrane_response — EMPROOF `response` op

• 資料種類:image2d → image2d

• 呼叫: import fullseye as fs; fs.ledger.seg_membrane_response(image, sigma: 'float' = 1.5, normalize: 'bool' = True) -> 'np.ndarray'(要直接呼叫實作,import emproof; emproof.seg_membrane_response(image, sigma: 'float' = 1.5, normalize: 'bool' = True) -> 'np.ndarray';從台帳取用則 opsemproof.get("seg_membrane_response"))

用法

> 該運算子的說明尚無譯文,以下照原文給出。

EM 断面の暗い線(細胞膜)の応答 [0, ∞)。ガウス平滑した Hessian の固有値 λ1 ≥ λ2 から

`max(λ1 − |λ2|, 0)` (Steger の線検出の閉形式、σ² で尺度正規化)。

暗い線の上では横断方向の 2 階微分が大きく正(λ1)、線に沿う方向は 0(λ2)なので λ1 − |λ2| が立つ。

暗い塊(ミトコンドリア内部・シナプス小胞)は λ1 ≈ λ2 > 0 で打ち消し合って 0 に近い ―― 膜だけを

拾う。`normalize=True で断面の 99.5 percentile を 1 にする(seg_*` の閾値はその尺度で書く)。

scikit-image があるならレジストリの `sk_frangi(fs.apply(img, "sk_frangi", a=0.5, b=0.5)`)も

同じ席に使える(試作はそちらで AUC を測った)。

Parameters

----------

image : (H, W) float

生 EM(明るい = 細胞質、暗い = 膜)。範囲は問わない(勾配の比だけを見る)。

sigma : float

平滑の σ [px]。膜の太さの半分程度(CREMI 4 nm/px なら 1.5〜2.5)。

詳細使用指南

• emproof 族使用指南

參考(範例資料・文獻)

• 範例資料目錄(下載 URL / 授權) —— 2-D 用 skimage.data(BSD/公有領域)加合成圖,3-D 給出真實資料源(Stanford/PDS 等)的下載 URL。

• 運算子來歷與參考文獻 —— 該運算子族所依據的研究/方法出處。

• 演算法的正典(作者・年份)與用途見上面的族使用指南。

可執行的範例(實際呼叫該運算子並已驗證的樣例)

• poc_em_second_opinion — py -3.11 examples/poc_em_second_opinion.py

型別可銜接的下一個運算子(可接受 `image2d` 作為輸入)

seg_membrane_chord_score · seg_boundary_membrane_gap

同類別(`response`)

—

*Provenance: emproof.py — EMPROOF 運算子登記表。本條目由 tools/opdocs.py md 自動產生(請勿手動編輯)。*

seg_membrane_response — EMPROOF response op

用法