medial op• 資料種類:voxel → flow_dense
• 呼叫: import fullseye as fs; fs.ledger.vol_nearest_seed_vector(vol_binary, spacing=None)(要直接呼叫實作,import volops; volops.vol_nearest_seed_vector(vol_binary, spacing=None);從台帳取用則 ops3d.get("vol_nearest_seed_vector"))
> 該運算子的說明尚無譯文,以下照原文給出。
各 voxel から最近の seed voxel への変位ベクトル `(3, D, H, W)(flow_dense`、成分 dz, dy, dx [voxel])。
seed = 非零 voxel(`> 0.5 で二値化)。seed の上では 0。vol_distance_transform` が返すのは距離の値だけで、
「どの voxel が最近か」は落ちる —— 骨格からの半径(表面 → 骨格の変位)、膜までの肉厚、ESDF の勾配、
ラベルのボロノイ分割はこの向きが要る(2026-09-21、コネクトーム基盤の穴)。`spacing (sz, sy, sx)` を渡すと
最近傍の判定は物理距離で行う(返す変位は voxel 単位のまま —— `|v * spacing|` が物理距離)。
厳密解: Maurer, Qi & Raghavan (IEEE TPAMI 2003) の線形時間 EDT(`scipy.ndimage.distance_transform_edt(return_indices=True)`)。
同距離の seed が複数あるときはその実装の順序で 1 つ(順序に意味を持たせないこと)。seed が 1 つも無いと
ValueError(全 voxel が無限遠 —— 黙って 0 を返さない)。
>>> v = np.zeros((5, 5, 5)); v[2, 2, 0] = 1
>>> d = vol_nearest_seed_vector(v); d.shape, tuple(d[:, 2, 2, 4])
((3, 5, 5, 5), (0.0, 0.0, -4.0))
• 範例資料目錄(下載 URL / 授權) —— 2-D 用 skimage.data(BSD/公有領域)加合成圖,3-D 給出真實資料源(Stanford/PDS 等)的下載 URL。
• 運算子來歷與參考文獻 —— 該運算子族所依據的研究/方法出處。
• nearest_seed_partition — py -3.11 examples_3d/nearest_seed_partition.py
flow_dense 作為輸入)medial)distance_ridge · skeletonize_vol · medial_axis_points · topology_signature · medial_match · skeleton_junctions3d · skeleton_endpoints3d · skeleton_prune3d
*Provenance: volops.py — 3D 運算子登記表。本條目由 tools/opdocs.py md 自動產生(請勿手動編輯)。*
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