seg_boundary_membrane_gap — EMPROOF `suspect` op

• Datenarten: labels2d × image2d → table

• Aufruf: import fullseye as fs; fs.ledger.seg_boundary_membrane_gap(labels, membrane, tau: 'float' = 0.2, min_len: 'int' = 60, normalize: 'bool' = True, ignore_zero: 'bool' = True) -> 'dict' (die Implementierung direkt: import emproof; emproof.seg_boundary_membrane_gap(labels, membrane, tau: 'float' = 0.2, min_len: 'int' = 60, normalize: 'bool' = True, ignore_zero: 'bool' = True) -> 'dict'; aus dem Register: opsemproof.get("seg_boundary_membrane_gap"))

Verwendung

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分断の疑い: 隣接する 2 ラベルの境界画素のうち、膜応答が `tau` 未満の割合。隣接対ごとに 1 行。

細胞の境目には必ず膜(暗い線)がある。膜が無いのにラベルが変わる境界は、1 細胞を 2 つに切った

分断の跡(`seg_inject_split` の直線はまさにこれ)。4 近傍で異ラベルが接する画素を数え、境界の膜応答は

両側の強い方をとる。CREMI sample A の試作で人工分断 vs 他: AUC 0.99(tau 0.2、境界長 ≥ 60)。

列: `label_a / label_b(a < b)/ length / gap_fraction / membrane_mean`(gap_fraction 降順)。

`min_len` px 未満の短い境界は数えない(数画素の接触は膜の有無を言えない)。

>>> table = seg_boundary_membrane_gap(labels, seg_membrane_response(raw))

>>> table["label_a"][0], table["label_b"][0], table["gap_fraction"][0] # いちばん怪しい対

Ausführlicher Anwendungsleitfaden

• Leitfaden zur Familie emproof

Referenzen (Beispieldaten, Literatur)

• Katalog der Beispieldaten (Download-URLs / Lizenzen) — 2-D nutzt skimage.data (BSD/Public Domain) plus synthetische Bilder, 3-D nennt Download-URLs echter Datenquellen (Stanford, PDS, …).

• Herkunft und Literatur der Operatoren — die Quellen der Forschung/Verfahren, auf denen diese Operatorfamilie beruht.

• Der kanonische Algorithmus (Autor, Jahr) und seine Anwendungen stehen im Familienleitfaden oben.

Ausführbare Beispiele (verifizierte Samples, die diesen Operator wirklich aufrufen)

• poc_em_second_opinion — py -3.11 examples/poc_em_second_opinion.py

Typkompatible Folge-Operatoren (nehmen `table` als Eingabe)

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Gleiche Kategorie (`suspect`)

seg_membrane_chord_score

*Provenance: emproof.py — EMPROOF Operator-Registry. Diese Notiz wird von tools/opdocs.py md erzeugt (nicht von Hand bearbeiten).*

seg_boundary_membrane_gap — EMPROOF suspect op