LICENSE
README.md
pyproject.toml
src/mccetools/__init__.py
src/mccetools/cli.py
src/mccetools/core.py
src/pdbtools/__init__.py
src/pdbtools/cli.py
src/pdbtools/core.py
src/pymcce/__init__.py
src/pymcce/cli.py
src/pymcce/constants.py
src/pymcce/core.py
src/pymcce/mcce.py
src/pymcce/utils.py
src/pymcce.egg-info/PKG-INFO
src/pymcce.egg-info/SOURCES.txt
src/pymcce.egg-info/dependency_links.txt
src/pymcce.egg-info/entry_points.txt
src/pymcce.egg-info/requires.txt
src/pymcce.egg-info/top_level.txt
src/pymcce/data/ftpl/BCT_OG.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/CHL_QMhybrid_head+dipole.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/CT1_QMhybrid_tail.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/CT2_QMhybrid_tail.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/CT3_QMhybrid_tail.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/CT4_QMhybrid_tail.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/DGD_GR.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/FME_GR.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/PHO_GR.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/PL9_OGedit.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/SQD_GR.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/_K_.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/_ca.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/_cl.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/_mg.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/_na.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/_zn.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/ala.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/arg.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/asn.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/asp.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/bcr.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/ctr.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/cyd.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/cyl.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/cys.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/extra.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/fe2_OG.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/gln.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/glu.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/gly.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/gol_GR.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/hem_OG.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/hil.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/his.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/hoh.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/ile.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/leu.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/ligand_detect_rules.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/loose_cofactors.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/lys.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/mel.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/mem.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/met.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/no3.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/ntg.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/ntr.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/oeh.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/paa_OG.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/pdd_OG.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/phe.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/pro.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/ser.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/thr.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/trp.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/tyr.ftpl
src/pymcce/data/ftpl/val.ftpl
src/pymcce/data/prm/rename.txt
src/pymcce/data/prm/rotamer_level1.prm
src/pymcce/data/prm/rotamer_level2.prm
src/pymcce/data/prm/rotamer_level3.prm
src/pymcce/data/prm/run.prm.default
src/pymcce/data/prm/run.prm.old
tests/test_connect12.py
tests/test_getpdb.py
tests/test_ljenergy.py
tests/test_load_prm.py
tests/test_preprocess.py
tests/test_renamerules.py
tests/test_renaming.py
tests/test_resources.py
tests/test_sas.py
tests/test_split_models.py
tests/test_swing_function.py
tests/test_tpl.py
tests/test_transformation.py