python3 /data/project/Alzheimer/YSscript/cle/CLEMENT_bm.py  --INPUT_TSV /data/project/Alzheimer/YSscript/cle/TOOL/CLEMENT/example/2.CellData/MRS_2D/M1-8_M2-4/M1-8_M2-4_input.txt  --RANDOM_PICK 500 --AXIS_RATIO -1.0 --PARENT_RATIO 0.0 --NUM_PARENT 0 --FP_RATIO 0.0 --FP_USEALL False  --FP_PRIOR 0.01 --TN_PRIOR 0.99  --DEPTH_CUTOFF 100 --MIN_CLUSTER_SIZE 9   --KMEANS_CLUSTERNO 8 --RANDOM_SEED 1  --CLEMENT_DIR /data/project/Alzheimer/YSscript/cle/TOOL/CLEMENT/example/2.CellData/MRS_2D/M1-8_M2-4  --IMAGE_FORMAT jpg --VISUALIZATION True  --MODE Both --SCORING True --MAKEONE_STRICT 1 --MAXIMUM_NUM_PARENT 1 --MODEL betabinomial --COMPULSORY_NORMALIZATION 3 --SOFT_LENIENT 3 --NUM_CLONE_TRIAL_START 3 --NUM_CLONE_TRIAL_END 6 --TRIAL_NO 5   --VERBOSE 2
