filter_by_volume — 3D `regionprops` op

• 資料種類:voxel → voxel

• 呼叫: import fullseye as fs; fs.ledger.filter_by_volume(vol, min_voxels: 'int', connectivity: 'int' = 26) -> 'np.ndarray'(要直接呼叫實作,import regionprops3d; regionprops3d.filter_by_volume(vol, min_voxels: 'int', connectivity: 'int' = 26) -> 'np.ndarray';從台帳取用則 ops3d.get("filter_by_volume"))

用法

回傳去除了小於 min_voxels 的連通成分後的 bool 遮罩。

Parameters

vol : array_like

bool 或 0/1 的 3D 陣列。

min_voxels : int

去掉「小於」此閾值(< min_voxels)的元件。「大於等於」閾值的保留。

connectivity : int

6 / 18 / 26。

Returns

ndarray(bool)

僅滿足條件的元件為 True。沒有前景或全部元件被去除時為全 False。

補充:

• min_voxels 先用 int() 取整再比較。1 以下時所有元件都保留。

• 內部為 label_components → bincount → 保留 counts >= min_voxels 的標籤。不重新編號,只回傳 bool 遮罩,因此需要編號時將結果再次傳給 label_components。

• 輸入以 0 以外為前景轉為 bool(NaN 也是前景)。軸順序 (z, y, x)。

• Raises ValueError:非 3 維輸入,connectivity 不是 6/18/26。

• 體素數未做間距校正,因此依實際尺寸設閾值時,先除以體素體積再傳入。

背景知識指南(該運算子背後的物理與規範)

• measurement_uncertainty — 量測不確定度與校正知識 —— 為了能主張「量得準」

參考(範例資料、文獻)

• 範例資料目錄(下載 URL / 授權) —— 2-D 用 skimage.data(BSD/公有領域)加合成圖,3-D 給出真實資料源(Stanford/PDS 等)的下載 URL。

• 運算子來歷與參考文獻 —— 該運算子族所依據的研究/方法出處。

可執行的範例(實際呼叫該運算子並已驗證的樣例)

• region_props_3d — py -3.11 examples_3d/region_props_3d.py

型別可銜接的下一個運算子(可接受 `voxel` 作為輸入)

voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa

同類別(`regionprops`)

label_components · region_props · largest_component · inner_box3 · vol_label · vol_region_props

*Provenance: regionprops3d.py — 3D 運算子登記表。本條目由 tools/opdocs.py md 自動產生(請勿手動編輯)。*

filter_by_volume — 3D regionprops op

用法