cif_read — DRIVE pxrd op

• 資料種類:any → table

• 呼叫: import fullseye as fs; fs.ledger.cif_read(cif, name=None, default_b=0.5)(要直接呼叫實作,import pxrd; pxrd.cif_read(cif, name=None, default_b=0.5);從台帳取用則 opsdrive.get("cif_read"))

用法

讀取 CIF(晶體結構的標準格式)，回傳展開到晶胞內全部原子的「物相」。

> 以下的詳細說明為原文 —— 摘要與標題已翻譯。

cif はファイルのパスか CIF の本文(文字列。data_ か _cell_length_a を含むなら本文とみなす)。

読むもの: _cell_length_a/b/c・_cell_angle_alpha/beta/gamma、対称操作のループ(_space_group_symop_operation_xyz か _symmetry_equiv_pos_as_xyz、無ければ恒等だけ)、原子のループ(_atom_site_fract_x/y/z、_atom_site_type_symbol(無ければラベルの先頭の元素記号)、_atom_site_occupancy (既定 1)、_atom_site_U_iso_or_equiv か _atom_site_B_iso_or_equiv(無ければ default_b [Ų]))。数値の不確かさの括弧(4.76050(5))は落とす。対称操作は自前の小さな構文解析で読み、eval しない。

返り値(dict、相): name・cell(a, b, c [Å], α, β, γ [deg])・volume [ų]・atoms(展開後の原子の

list: type・xyz・occ・B)・cell_mass [g/mol]・density [g/cm³]・notes(中性原子で代用したイオンなど)・source(DOI と COD 番号があれば)。powder_reflections と phase_dictionary の入力。

Raises ValueError: 格子定数が無い・数値でない、対称操作が読めない、原子が無い、散乱因子の無い元素。

參考(範例資料、文獻)

• 範例資料目錄(下載 URL / 授權) —— 2-D 用 skimage.data(BSD/公有領域)加合成圖,3-D 給出真實資料源(Stanford/PDS 等)的下載 URL。

• 運算子來歷與參考文獻 —— 該運算子族所依據的研究/方法出處。

• 演算法的正典(作者、年份)與用途見上面的族使用指南。

可執行的範例(實際呼叫該運算子並已驗證的樣例)

• poc_pxrd_phase_peel — py -3.11 examples/poc_pxrd_phase_peel.py

型別可銜接的下一個運算子(可接受 table 作為輸入)

course_layout · course_occupancy · course_contains · world_build · world_camera · world_move · lidar_scan · rss_longitudinal_same

同類別(pxrd)

cubic_prototype · powder_reflections · scherrer_size · debye_ring_image · detector_two_theta · detector_calibrate · azimuthal_integrate · diffraction_peaks

*Provenance: pxrd.py — DRIVE 運算子登記表。本條目由 tools/opdocs.py md 自動產生(請勿手動編輯)。*

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