select op• データ種: labels → labels
• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.vol_select_labels(labels, props=None, spacing=None, relabel: 'bool' = False, exclude_border: 'bool' = False, keep=None, **criteria) (実装を直接呼ぶなら import volcolor; volcolor.vol_select_labels(labels, props=None, spacing=None, relabel: 'bool' = False, exclude_border: 'bool' = False, keep=None, **criteria)、台帳から引くなら opsvolcolor.get("vol_select_labels"))
• 台帳経由の戻り値: fullseye.ledger.vol_select_labels(...) は宣言 out 型 labels の値だけを返す(本体は補助情報も返す)。捨てられた側が要るときは fullseye.ledger.vol_select_labels.raw(...)、または volcolor.vol_select_labels を直接呼ぶ。
3-D の特徴で成分をふるいにかける(2-D のブロブ選別の 3-D 版)。
(labels_out, kept_ids) を返す。落ちた成分のボクセルは 0(背景)になる。
*props* は vol_label_shape_stats か volops.vol_region_props の返り値。None なら vol_label_shape_stats をその場で呼ぶ。
条件(すべて省略可・与えたものは AND):min_volume max_volume min_voxels max_voxels min_sphericity max_sphericity min_elongation max_elongation min_isotropy max_isotropy min_equivalent_diameter max_equivalent_diameter。加えて exclude_border=True でボリューム端に接する成分を落とす(CT の視野で切れている粒子を計測から外す標準手順)、keep=[...] で残す id を直接指定。
必要なキーが props に無ければ ValueError。たとえば min_sphericity を vol_label_shape_stats の結果に対して指定すると、sphericity はそちらが出さない量なので拒否する ―― 欠けたキーを既定値で埋めると「条件を書いたのに一件も落ちない」フィルタが黙って出来上がる。
relabel:
• False(既定)―― 元の id をそのまま残す。ゆえに vol_colorize_labels を前後で呼んでも残った成分の色は変わらない。「ふるいにかけて色が残っていく」図が成立するのはこの既定のおかげである。
• True ―― 残った成分を 1..k へ振り直す。色は総取り替えになる (ラベル番号がパレットの行番号だから)。下流が連番を要求する場合だけ使う。この 1 引数がこの族の売りを壊せる唯一の場所なので、明示的にした。
Returns (labels_out int32 (D, H, W), kept_ids np.ndarray int64). Raises ValueError for an unknown criterion, a criterion whose key is absent from *props*, a *props* that does not cover the labels present, or a *keep* containing a label that is not in the volume.
• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。
• アルゴリズムの正典(著者・年)と用途は上記ファミリ使い方ガイドに記載。
• voxel_labels_color — py -3.11 examples/voxel_labels_color.py
labels を入力に取れる)vol_colorize_labels · vol_label_overlay · vol_label_shape_stats · vol_label_legend · vol_labels_to_meshes · vol_label_volume_render
select)—
*Provenance: volcolor.py — VOLCOLOR operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。*
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