LICENSE
MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
src/FinaleToolkit.egg-info/PKG-INFO
src/FinaleToolkit.egg-info/SOURCES.txt
src/FinaleToolkit.egg-info/dependency_links.txt
src/FinaleToolkit.egg-info/entry_points.txt
src/FinaleToolkit.egg-info/requires.txt
src/FinaleToolkit.egg-info/top_level.txt
src/finaletoolkit/__init__.py
src/finaletoolkit/version.py
src/finaletoolkit/__pycache__/__init__.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/__init__.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/__init__.cpython-36.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/__init__.cpython-39.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/finaletools.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/finaletools.cpython-36.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/frag.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/utils.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/version.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/version.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/__pycache__/version.cpython-39.pyc
src/finaletoolkit/cli/__init__.py
src/finaletoolkit/cli/main_cli.py
src/finaletoolkit/cli/__pycache__/__init__.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/cli/__pycache__/__init__.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/cli/__pycache__/main_cli.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/cli/__pycache__/main_cli.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__init__.py
src/finaletoolkit/frag/adjust_wps.py
src/finaletoolkit/frag/cleavage_profile.py
src/finaletoolkit/frag/coverage.py
src/finaletoolkit/frag/delfi.py
src/finaletoolkit/frag/delfi_gc_correct.py
src/finaletoolkit/frag/delfi_merge_bins.py
src/finaletoolkit/frag/end_motifs.py
src/finaletoolkit/frag/frag_length.py
src/finaletoolkit/frag/multi_wps.py
src/finaletoolkit/frag/wps.py
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/__init__.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/__init__.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/adjust_wps.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/adjust_wps.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/agg_wps.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/cleavage_profile.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/cleavage_profile.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/coverage.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/coverage.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/delfi.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/delfi.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/delfi_gc_correct.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/delfi_gc_correct.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/delfi_merge_bins.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/delfi_merge_bins.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/end_motifs.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/end_motifs.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/frag_length.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/frag_length.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/multi_wps.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/multi_wps.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/process_wps.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/wps.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/frag/__pycache__/wps.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/frag/data/end_motif_f_profiles.tsv
src/finaletoolkit/genome/__init__.py
src/finaletoolkit/genome/gaps.py
src/finaletoolkit/genome/__pycache__/__init__.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/genome/__pycache__/__init__.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/genome/__pycache__/gaps.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/genome/__pycache__/gaps.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/genome/data/hg19.gap.txt.gz
src/finaletoolkit/genome/data/hg38.gap.txt.gz
src/finaletoolkit/utils/__init__.py
src/finaletoolkit/utils/agg_bw.py
src/finaletoolkit/utils/cli_hist.py
src/finaletoolkit/utils/filter_bam.py
src/finaletoolkit/utils/utils.py
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/__init__.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/__init__.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/agg_bw.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/agg_bw.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/cli_hist.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/cli_hist.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/filter_bam.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/filter_bam.cpython-312.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/frag_len_hist.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/utils.cpython-310.pyc
src/finaletoolkit/utils/__pycache__/utils.cpython-312.pyc
tests/test_agg_bw.py
tests/test_cleavage_profile.py
tests/test_cli_entry.py
tests/test_coverage.py
tests/test_delfi.py
tests/test_end_motifs.py
tests/test_frag_io.py
tests/test_gaps.py
tests/test_utils.py
tests/test_wps.py