.git-blame-ignore-revs
.git_archival.txt
.gitattributes
.gitignore
.pre-commit-config.yaml
.readthedocs.yaml
AGENTS.md
LICENSE
MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
.github/dependabot.yml
.github/ISSUE_TEMPLATE/bug_report.yml
.github/ISSUE_TEMPLATE/config.yml
.github/ISSUE_TEMPLATE/feature_request.yml
.github/ISSUE_TEMPLATE/generic-issue.yml
.github/workflows/benchmark.yml
.github/workflows/mirror_gitee.yml
.github/workflows/pub-pypi.yml
.github/workflows/pyright.yml
.github/workflows/test.yml
.github/workflows/test_import.yml
benchmark/__init__.py
benchmark/test_import.py
dpdata/__about__.py
dpdata/__init__.py
dpdata/__main__.py
dpdata/_version.py
dpdata/ase_calculator.py
dpdata/bond_order_system.py
dpdata/cli.py
dpdata/data_type.py
dpdata/driver.py
dpdata/format.py
dpdata/periodic_table.json
dpdata/periodic_table.py
dpdata/plugin.py
dpdata/py.typed
dpdata/stat.py
dpdata/system.py
dpdata/unit.py
dpdata/utils.py
dpdata.egg-info/PKG-INFO
dpdata.egg-info/SOURCES.txt
dpdata.egg-info/dependency_links.txt
dpdata.egg-info/entry_points.txt
dpdata.egg-info/requires.txt
dpdata.egg-info/top_level.txt
dpdata/formats/__init__.py
dpdata/formats/abacus/__init__.py
dpdata/formats/abacus/md.py
dpdata/formats/abacus/relax.py
dpdata/formats/abacus/scf.py
dpdata/formats/abacus/stru.py
dpdata/formats/amber/__init__.py
dpdata/formats/amber/mask.py
dpdata/formats/amber/md.py
dpdata/formats/amber/sqm.py
dpdata/formats/cp2k/__init__.py
dpdata/formats/cp2k/cell.py
dpdata/formats/cp2k/output.py
dpdata/formats/deepmd/__init__.py
dpdata/formats/deepmd/comp.py
dpdata/formats/deepmd/hdf5.py
dpdata/formats/deepmd/mixed.py
dpdata/formats/deepmd/raw.py
dpdata/formats/dftbplus/__init__.py
dpdata/formats/dftbplus/output.py
dpdata/formats/fhi_aims/__init__.py
dpdata/formats/fhi_aims/output.py
dpdata/formats/gaussian/__init__.py
dpdata/formats/gaussian/fchk.py
dpdata/formats/gaussian/gjf.py
dpdata/formats/gaussian/log.py
dpdata/formats/gromacs/__init__.py
dpdata/formats/gromacs/gro.py
dpdata/formats/lammps/__init__.py
dpdata/formats/lammps/dump.py
dpdata/formats/lammps/lmp.py
dpdata/formats/lmdb/__init__.py
dpdata/formats/lmdb/format.py
dpdata/formats/openmx/__init__.py
dpdata/formats/openmx/omx.py
dpdata/formats/orca/__init__.py
dpdata/formats/orca/output.py
dpdata/formats/psi4/__init__.py
dpdata/formats/psi4/input.py
dpdata/formats/psi4/output.py
dpdata/formats/pwmat/__init__.py
dpdata/formats/pwmat/atomconfig.py
dpdata/formats/pwmat/movement.py
dpdata/formats/pymatgen/__init__.py
dpdata/formats/pymatgen/molecule.py
dpdata/formats/pymatgen/structure.py
dpdata/formats/qe/__init__.py
dpdata/formats/qe/scf.py
dpdata/formats/qe/traj.py
dpdata/formats/rdkit/__init__.py
dpdata/formats/rdkit/sanitize.py
dpdata/formats/rdkit/utils.py
dpdata/formats/siesta/__init__.py
dpdata/formats/siesta/aiMD_output.py
dpdata/formats/siesta/output.py
dpdata/formats/vasp/__init__.py
dpdata/formats/vasp/outcar.py
dpdata/formats/vasp/poscar.py
dpdata/formats/vasp/xml.py
dpdata/formats/xyz/__init__.py
dpdata/formats/xyz/quip_gap_xyz.py
dpdata/formats/xyz/xyz.py
dpdata/md/__init__.py
dpdata/md/msd.py
dpdata/md/pbc.py
dpdata/md/rdf.py
dpdata/md/water.py
dpdata/plugins/3dmol.py
dpdata/plugins/__init__.py
dpdata/plugins/abacus.py
dpdata/plugins/amber.py
dpdata/plugins/ase.py
dpdata/plugins/cp2k.py
dpdata/plugins/deepmd.py
dpdata/plugins/dftbplus.py
dpdata/plugins/fhi_aims.py
dpdata/plugins/gaussian.py
dpdata/plugins/gromacs.py
dpdata/plugins/lammps.py
dpdata/plugins/list.py
dpdata/plugins/lmdb.py
dpdata/plugins/n2p2.py
dpdata/plugins/openmx.py
dpdata/plugins/orca.py
dpdata/plugins/psi4.py
dpdata/plugins/pwmat.py
dpdata/plugins/pymatgen.py
dpdata/plugins/qe.py
dpdata/plugins/rdkit.py
dpdata/plugins/siesta.py
dpdata/plugins/vasp.py
dpdata/plugins/xyz.py
skills/dpdata-cli/README.md
skills/dpdata-cli/SKILL.md
skills/dpdata-driver/SKILL.md
skills/dpdata-minimizer/SKILL.md
skills/dpdata-plugin/SKILL.md