LICENSE
MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
requirements.txt
setup.py
docs/EXECUTION_MODES.md
docs/ORGANIZATION.md
docs/PHASE0_ACTION_VARIANTS.md
docs/PHASE1_VERIFICATION_SUMMARY.md
docs/PHASE2_VERIFICATION_SUMMARY.md
docs/PHASE_GATES_EXPLANATION.md
docs/PHASE_STATUS_ACCURATE.md
docs/PHASE_STATUS_CANONICAL.md
docs/Project_Readmes.md
docs/README.md
docs/SYSTEM_REVIEW_20260113.md
docs/architecture/ARCHITECTURE.md
docs/architecture/README.md
docs/axioms/AXIOMS.md
docs/axioms/README.md
docs/history/CORRECTIONS_APPLIED.md
docs/history/README.md
docs/history/WORK_LOG.md
docs/simple/INDEPENDENCE_CHECK.md
docs/simple/PHASE0_TO_PHASE3_STORY.md
docs/simple/README.md
src/phase0/README.md
src/phase0/__init__.py
src/phase0/action.py
src/phase0/actions.py
src/phase0/phase0.py
src/phase0/repetition.py
src/phase0/trace.py
src/phase0/phase0/PHASE0_FREEZE.md
src/phase0/phase0/docs/PHASE0_FINAL_VERIFICATION.md
src/phase0/phase0/docs/README.md
src/phase1/README.md
src/phase1/__init__.py
src/phase1/boundary.py
src/phase1/cluster.py
src/phase1/distance.py
src/phase1/pattern.py
src/phase1/phase1.py
src/phase1/docs/PHASE1_COMPLIANCE_VERIFICATION.md
src/phase1/docs/README.md
src/phase1/phase1/PHASE1_FREEZE.md
src/phase1/phase1/PHASE1_IMPLEMENTATION_PROMPT.md
src/phase1/phase1/PHASE1_IMPLEMENTATION_PROMPT_FINAL.md
src/phase1/phase1/PHASE1_TRANSITION.md
src/phase1/phase1/README.md
src/phase2/README.md
src/phase2/__init__.py
src/phase2/identity.py
src/phase2/persistence.py
src/phase2/phase2.py
src/phase2/repeatable.py
src/phase2/stability.py
src/phase2/docs/PHASE2_COMPLIANCE_VERIFICATION.md
src/phase2/docs/README.md
src/phase2/phase2/PHASE2_FREEZE.md
src/phase2/phase2/PHASE2_IMPLEMENTATION_PROMPT_FINAL.md
src/phase2/phase2/PHASE2_PROMPT_SUMMARY.md
src/phase2/phase2/README.md
src/phase3/__init__.py
src/phase3/dependency.py
src/phase3/graph.py
src/phase3/influence.py
src/phase3/interaction.py
src/phase3/persistence.py
src/phase3/phase3.py
src/phase3/relation.py
src/phase3/stability.py
src/phase3/phase3/PHASE3_COMPLETION_PROMPT.md
src/phase3/phase3/PHASE3_FREEZE.md
src/phase3/phase3/PHASE3_FREEZE_new.md
src/phase3/phase3/PHASE3_IMPLEMENTATION_FINAL.md
src/phase3/phase3/PHASE3_IMPLEMENTATION_PROMPT_FINAL.md
src/phase3/phase3/PHASE3_PERSISTENCE.md
src/phase3/phase3/PHASE3_PROMPT_SUMMARY.md
src/phase3/phase3/README.md
src/phase4/__init__.py
src/phase4/alias.py
src/phase4/phase4.py
src/phase4/phase4/PHASE4_FREEZE.md
src/phase4/phase4/PHASE4_IMPLEMENTATION_PLAN_FINAL.md
src/threshold_onset.egg-info/PKG-INFO
src/threshold_onset.egg-info/SOURCES.txt
src/threshold_onset.egg-info/dependency_links.txt
src/threshold_onset.egg-info/not-zip-safe
src/threshold_onset.egg-info/requires.txt
src/threshold_onset.egg-info/top_level.txt
src/tools/README.md
src/tools/version_control.py
src/tools/watch_version.py
src/tools/docs/README.md
src/tools/docs/VERSION_CONTROL.md